Harmonizome数据库 – 一个集合多种pathway（or other）的网站

Harmonizome数据库 – 一个集合多种pathway（or other）的网站

1. Harmonizome数据库包含多种常用的数据信息，如基因、蛋白质等等。其网址为/ https://maayanlab.cloud/Harmonizome/

其主界面如下:

2. 此外，该网站最大的特点是整理了多种数据库链接，比如常用的KEGG、reactome等。
下面展示了KEGG的搜索结果：
3. 本人实测后，发现该数据库内容信息虽然全面并且经过整理，但更新并不及时，且数据量较少，因此建议从该数据库链接到每个单独的数据库后再执行相应任务。

4. 今天使用了Reactome数据库，感觉还不错，分享给大家。这个数据库特点是数据量大，我下载了所有的Pathway（https://reactome.org/download/current/ReactomePathways.gmt.zip）共704个，感觉还是很多的。 但下载出来的pathway gene sets有些看不懂是什么意思。