clusterProfiler安装或者升级中出现的版本问题

最新推荐文章于 2024-07-07 18:24:00 发布

小七毛

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分类专栏： R 文章标签： clusterProfiler

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1、之前按照官网的流程，如下，安装了该包并载入DOSE之后一直提示装不上enrich plot：

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("clusterProfiler")

2、

3、该问题的意思是R 3.4.3版本的不能装enrichplot，但是官方手册又说只要R版本>=3.4.0就ok。

4、于是我通过GitHub的方法装上了enrichplot，此时要注意的是，DOSE也同时升级了，如果你强行载入clusterProfiler的话，就会出现各种版本不兼容的提示，大致如下：

5、此时问题的解决方案就是，首先保证enrichplot以及DOSE都是通过GitHub方式装的，然后载入他们，最后再通过github的方式（devtools::install_github('GuangchuangYu/clusterProfiler')）装上clusterProfiler。搞定！