报错记录：findmarkers：Error in h(simpleError(msg, call))

已于 2023-10-12 16:05:50 修改
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文章标签： 学习方法 r语言
于 2023-10-12 16:05:21 首次发布
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版权 
df <- FindMarkers(sc, 
                  ident.1 = "Fellow",
                  features = gene,
                  min.pct = 0,
                  logfc.threshold = 0)

Error in h(simpleError(msg, call)) : 
  在为'rowSums'函数选择方法时评估'x'参数出了错: 类别为'S4'的对象不可以取子集
Error in h(simpleError(msg, call)) : 
  在为'rowSums'函数选择方法时评估'x'参数出了错: subscript out of bounds

跑FindMarkers报了两个错，检查：

1.DefaultAssay(sc) <- 'RNA'

2.features里的gene在sc里有没有

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如果您在编译过程中遇到了类似"error: text.h: No such file or directory"的错误，这意味着编译器无法找到名为"text.h"的头文件。 有几种可能的原因和解决方法： 1. 检查文件名和路径：确保您的代码中正确引用了正确的头文件名和路径。可能是在包含头文件时发生了误导或拼写错误。 2. 检查头文件位置：确认头文件"text.h"是否位于正确的位置。如果不在当前目录下，您可能需要使用相对路径或绝对路径来引用它。 3. 检查编译器设置：请确保编译器能够正确找到头文件。这可能需要您在编译命令中添加额外的包含路径选项（例如，`-I/path/to/header`）。 4. 检查依赖项：如果"text.h"是由其他库提供的头文件，您需要确保正确安装了该库并正确设置了相关的包含路径。 请根据具体情况检查和调试这些可能的原因，并采取适当的解决方法。如果您能提供更多的上下文或代码示例，我将能够提供更具体的帮助。
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