GROMACS出现报错:没有那个文件或目录
在Ubuntu18.04下安装GROMACS2021,按照GROMACS官网给出的Installation guide — GROMACS 2021.5 documentation安装中的“Quick and dirty installation”进行安装。
具体代码如下(已修改成了GROMACS2021版本使用代码):
tar xfz gromacs-2021.tar.gz
cd gromacs-2021
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
make
make check
sudo make install
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
在安装到最后一步source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
出现报错。
出现报错:没有那个文件或目录(不论我如何更换GMXRC的地址)
但是使用gmx --version检查时,成功安装。
猜想是没有找到正确的地址,比较一下教程分享的安装成功的和自己的gmx信息。果然发现:
自己的:
其他人安装成功的:
其中Executable
的地址不同,也就分别对应
# 提示找不到那个文件或目录的错误版本
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
# 修改后的source的代码
source /usr/local/bin/GMXRC
补充:
这里的source:
语法格式:source filepath
功能:使当前shell读入路径为filepath的shell文件并依次执行文件中的所有语句,通常用于重新执行刚修改的初始化文件,使之立即生效,而不必注销并重新登录。
后续补充:
最近继续学习gmx手册,发现手册里面安装的时候对路径有具体说明,都怪当时太小白了。