Ubuntu18.04下安装GROMACS2021source出错

本文讲述了在Ubuntu 18.04环境下尝试快速安装GROMACS 2021时遇到的GMXRC路径错误,通过对比安装成功案例和修正源代码,发现Executable地址的不同导致问题。作者揭示了正确设置GMXRC路径的方法,供其他遇到类似问题的读者参考。
摘要由CSDN通过智能技术生成

GROMACS出现报错:没有那个文件或目录

在Ubuntu18.04下安装GROMACS2021,按照GROMACS官网给出的Installation guide — GROMACS 2021.5 documentation安装中的“Quick and dirty installation”进行安装。

具体代码如下(已修改成了GROMACS2021版本使用代码):

tar xfz gromacs-2021.tar.gz
cd gromacs-2021
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
make
make check
sudo make install
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC

在安装到最后一步source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC出现报错。
在这里插入图片描述

出现报错:没有那个文件或目录(不论我如何更换GMXRC的地址)

但是使用gmx --version检查时,成功安装。

在这里插入图片描述

猜想是没有找到正确的地址,比较一下教程分享的安装成功的和自己的gmx信息。果然发现:

自己的:在这里插入图片描述

其他人安装成功的:
请添加图片描述

其中Executable的地址不同,也就分别对应

# 提示找不到那个文件或目录的错误版本
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC

# 修改后的source的代码
source /usr/local/bin/GMXRC

补充

这里的source

语法格式:source filepath

功能:使当前shell读入路径为filepath的shell文件并依次执行文件中的所有语句,通常用于重新执行刚修改的初始化文件,使之立即生效,而不必注销并重新登录。


后续补充:

最近继续学习gmx手册,发现手册里面安装的时候对路径有具体说明,都怪当时太小白了。

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