r运行太慢怎么办

最新推荐文章于 2025-01-09 21:25:55 发布
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分类专栏： 数据处理 dataframe tibble 数据清洗 文章标签： ubuntu
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很多人的R语言会卡就是因为这个数字太小了，如果你的电脑是64位的，那就输入memory.limit(102400)，把系统分配给R语言的内存使用上限调到100G

如果你的电脑是32位的，那就输入memory.limit(4000)，把系统分配给R语言的内存使用上限调到4G，因为32位系统只能支持4G内存

对于一些很大的但无用的中间变量，养成清理的习惯：可以使用rm(object)删除变量，但是记住，rm后记得使用gc()做Garbage collection，否则内存是不会自动释放的，相当于你没做rm.

 library(parallel) cl.cores <- detectCores()

rstudio跑不动咋整？-------生信豆芽菜
weixin_43949246的博客
04-13 990
我有时候在思考，这么一来配置的服务器，什么时候才可以回本，什么时候才可以盈利，在这个物欲横流的时代，让人不敢相信，后来，我详细了解了他们的平台，才发现，生信豆芽菜，是做数据挖掘起家，他们的公众号(生信豆芽菜)专门做文章复现，而且是纯代码复现的那种。我不是她，我也无法理解，她在做什么？我活着是为了什么呢？但是在她身上我看到了曾经的艰难，曾经为了学习所经历的一切，曾经的曾经，我们也是这样，在满怀希望和期待，我开始写CSDN，开始做技术共享，可是多年过去了，曾经的雄心早已不在，剩下的只有被生活抹去棱角的我！
R语言多线程运算（解决R循环慢的问题）
热门推荐
u011454283的专栏
09-10 2万+
已经大半年没有更新博客了。。最近都跑去写分析报告半年没有R 这次记录下关于R循环（百万级以上）死慢死慢的问题，这个问题去年就碰到过，当时也尝试过多线程，but failed......昨天试了下，终于跑通了，而且过程还挺顺利 step1 先查下自己电脑几核的，n核貌似应该选跑n个线程，线程不是越多越好，线程个数和任务运行时间是条开口向下的抛物线，最高点预计在电脑的核数上。de
R语言跑不动
weixin_35626107的博客
07-10 286
编程语言,编程,数据分析,数据结构相关视频讲解：python的or运算赋值用法用python编程Excel有没有用处？011_编程到底好玩在哪？查看python文件_输出py文件_cat_运行python文件_shel解决R语言跑不动的问题 背景介绍 在数据分析领域，R语言是一种常用的编程语言，但有时候我们会遇到R语...
R语言运行速度太慢？提速技巧
最新发布
青笋的博客
01-09 832
然而，随着数据规模的增大和计算任务的复杂化，R语言的性能问题逐渐成为用户关注的焦点。本文详细介绍R语言性能提升的多种方法，从基础优化到高级技巧，希望对您有所帮助。Rcpp是R语言与C++的接口包，允许用户编写C++代码并将其集成到R中。R语言提供了多种数据结构（如矩阵、数据框、列表等），选择合适的数据结构可以提升性能。R语言作为数据分析和统计建模的利器，凭借其丰富的包生态系统和灵活的语法，深受数据科学家和生物信息学家喜爱。profvis包是R语言的性能分析工具，可以帮助用户定位代码中的性能瓶颈。
R语言程序一直在运行
weixin_40421842的博客
08-10 449
R语言程序一直在运行：解析与解决方案 引言 R语言是一种用于统计计算和数据分析的编程语言，广泛应用于数据科学和机器学习等领域。然而，有时候R程序会因为某些原因一直处于“运行中”状态，导致用户无法得到期望的结果。在本文中，我们将探讨造成这一现象的原因以及如何解决这个问题，并附上代码示例和相关的流程图。 常见原因 无限循环：...
如何加速R？
R语言中文社区
10-14 2416
在挖了n个R的坑之后，我还是决定把自己遇到的坑都写一下，免得自己又重复掉进相同的坑里。关于R语言加速的问题，《Advanced R》里面的一句让我印象深刻：Optimis...
r语言热图太大卡死怎么办_R语言学习 – 热图绘制 (heatmap)
weixin_28965851的博客
01-12 2738
热图绘制热图是做分析时常用的展示方式，简单、直观、清晰。可以用来显示基因在不同样品中表达的高低、表观修饰水平的高低等。任何一个数值矩阵都可以通过合适的方式用热图展示。本篇使用R的ggplot2包实现从原始数据读入到热图输出的过程，并在教程结束后提供一份封装好的命令行绘图工具，只需要提供矩阵，即可一键绘图。上一篇讲述了Rstudio的使用作为R写作和编译环境的入门，后面的命令都可以拷贝到Rstudi...
Rstudio下载包太慢
07-14
RStudio是一个流行的集成开发环境（IDE），用于编写和运行R语言代码。如果你在下载R包时遇到速度慢的问题，可以尝试以下几个解决方案： 1. **检查网络连接**：确保你的网络连接稳定且速度快。如果网络状况不佳，试...
linux+运行c+速度慢,c ++ - Linux上的memcpy性能不佳
weixin_40001519的博客
05-02 1061
我们最近购买了一些新的服务器，并且正在经历糟糕的memcpy性能。 与我们的笔记本电脑相比，服务器上的memcpy性能要慢3倍。服务器规格底盘和Mobo：SUPER MICRO 1027GR-TRFCPU：2x Intel Xeon E5-2680 @ 2.70 Ghz内存：8x 16GB DDR3 1600MHz编辑：我也在另一台具有更高规格的服务器上进行测试，并看到与上述服务器相同的结果服务器...
下载matlab安装包太慢_软件安装不上，可能是网速慢！Conda/R/pip/brew等国内镜像大全拿走不谢~~...
weixin_39781599的博客
01-30 1489
软件安装是生信分析的基础，除了掌握基本的软件安装理论外之后 (Linux - 命令运行监测和软件安装)，就是去下载源码安装或使用包管理工具安装。通常操作都没问题时，软件却怎么都装不上，这一般都是网络问题。所以你需要一个能够快速访问的镜像，下载快还不容易断。Conda镜像Conda增加清华的镜像，运行下面的代码 (后添加的通道优先级更高)conda config --add channels htt...
matlab ga工具箱 并行 慢,什么使Matlab的小波工具箱的运算太慢或可能加速
weixin_36277197的博客
03-17 676
1. 在Matlab (R2011a)的命令窗口中，运行(Copy、Paste、回车):tic; for ii=1:4;indata=randn(1,256);dwtmode('per');wptri =wpdec(indata,8,'sym31', 'norm',1);wptri =besttree(wptri);end; toc得到: Elapsed time is 76.249247 sec...
R语言记录程序运行的时间
weixin_33941350的博客
07-22 1993
f &lt;- function(start_time) { start_time &lt;- as.POSIXct(start_time) dt &lt;- difftime(Sys.time(), start_time, units="secs") # Since you only want the H:M:S, we can ignore the date... # ...
给你的R语言再次提速
医学和生信笔记的博客
08-08 938
包的作者是一位人类遗传学的博士生，需要处理的数据都是量级非常大的，但是作者非常喜欢用R语言，众所周知，R语言很慢！所以作者才开发了这个包解决自己的实际需求！R包bigstatsr提供了大规模矩阵数据进行快速统计分析的函数。主要是使用了FBM（filebacked big matrices）和内存映射（memory-mapping）技术。不光是生物信息学的数据，其他的类似数据都可以使用这个包进行处理哦！注意：此包的多数算法都不能处理缺失值！...
加快R的运行速度
程志伟的博客
03-11 4859
各位朋友，我已开通微信公共号：小程在线 我会把文章及时的更新到公共号上，欢迎大家的关注。 源文件：http://pan.baidu.com/s/1o7g4edc 可以先运行下，观察此时的运动状态 x<-matrix(1:(6666*6666),6666,6666) system.time(tmp<-x%*%x) 1.下载文件，进行解压 2.将找到 解压文件下...
Rstudio 提高效率的技巧
iamnull0000的博客
03-23 1533
我们在Windows或linux日常操作中，经常会使用一些快捷键提升工作效率，在RStudio中也有不少快捷键，可以大幅度提升R语言代码编写和日常操作的效率。有时写一大段代码，只想执行其中某几行看看结果或者调试一下，可以选择代码块，使用【Ctrl+Enter】快捷键即可执行选中的代码。【Ctrl+Shift+F10】快捷键可以重新启动R，有些情况下需要重新启动R，初始化一下环境，无需关闭整个Rstudio。在linux终端环境中，【Ctrl+L】可以快速清理屏幕，在RStudio中也是类似的。
让你的R语言提速100倍
医学和生信笔记的博客
08-07 2070
OpenBlas是一个开源项目，是由中科院软件所并行软件与计算科学实验室发起的基于GotoBLAS21.13BSD版的开源BLAS库高性能实现。BLAS（BasicLinearAlgebraSubprograms基础线性代数程序集）是一个应用程序接口（API）标准，用以规范发布基础线性代数操作的数值库（如矢量或矩阵乘法）。该程序集最初发布于1979年，并用于建立更大的数值程序包（如LAPACK）。在高性能计算领域，BLAS被广泛使用。OpenBlasGithub。...
R语言-理解R性能
炫炫有牛腩 的博客
02-13 4239
计算性能限制因素通过了解限制R计算性能的因素，从而更好的利用起R的性能，影响R的因素：CPU,RAM,磁盘I/O,算法。 CPU的速度和性能觉得了计算速度，它需要将R代码翻译成机器语言和实际处理时的执行过程。另外R是单线程的，即整个数据集都在一个CPU核上运行，所以你即使拥有一个多核的CPU，并没有什么用。但是并行编程可以克服这个问题。 RAM限定了数据的规模。数据都是先加载到RAM中，所以数据大小
优化你的R代码：提高效率的技巧和策略
DevNinja的博客
08-27 241
这些是一些优化R代码的特殊技巧和策略，希望能帮助你提高代码的执行效率。记住，在优化代码之前，先进行性能测试和基准测试，以确定哪些部分需要优化，并确保优化不会损害代码的可读性和可维护性。R语言是一种功能强大的统计分析和数据可视化工具，但在处理大型数据集或复杂计算任务时，代码的效率可能成为一个关键问题。本文将介绍一些优化R代码的特殊技巧和策略，帮助你提高代码的执行速度并更高效地利用资源。在R中，选择合适的数据结构可以显著提高代码的执行效率。通过将关键代码片段编译为机器码，可以显著提高代码的执行速度。
求助R语言harmonise问题
i257257的博客
01-02 680
提供 2 个项分配给第 'SNP_index' 列中的第 1 组，组的大小为 0 RHS 的长度必须是 1(可以是单个值) 或完全符合 LHS 的长度如果您想回收(recycle) RHS，请使用 rep() 向你的代码读者明确表达你的意图。如图所示，merge之类都挺顺畅，但是harmonise出现了问题。
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