Guppy Basecalling

Guppy Basecalling 软件

使用方法

使用配置文件：

guppy_basecaller-i <输入路径> -s <保存路径> -c <配置文件> [选项]

使用 flowcell 和 kit 名称：

guppy_basecaller -i <输入路径> -s <保存路径> --flowcell <flowcell名称>
    --kit <kit名称>

列出支持的 flowcells 和 kits：

guppy_basecaller --print_workflows

使用 GPU 进行 basecalling：

guppy_basecaller -i <输入路径> -s <保存路径> -c <配置文件>
    --device <cuda设备名称>