ubuntu20.04 rMATS4.0.1安装及报错解决

最新推荐文章于 2024-01-24 07:01:59 发布
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文章标签： linux 运维 服务器
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本文介绍了在Ubuntu 20.04上安装rMATS4.0.1的步骤，包括下载、解压和运行，以及遇到的依赖库问题。在安装过程中遇到了libgfortran3和libgsl.so.0的缺失，通过安装相应库解决了问题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

安装rMATS4.0.1

  • wget -c http://rnaseq-mats.sourceforge.net/rmats4.0.1/rMATS.4.0.1.tgz

  • tar -zxvf rMATS.4.0.1.tgz

  • cd rMATS.4.0.1

  • 具体使用及注意事项可参考：简书

  • 我的运行命令

  • (py2) chentianxin@vm:~/rMATS.4.0.1/rMATS-turbo-Linux-UCS4$ python rmats.py --b1 b1.txt --b2 b2.txt --gtf Csiv4_gene_model.gtf --od /home/chentianxin/rMATS.4.0.1 -t paired --readLength 150 --cstat 0.05 --nthread 8

  • 报错

  • 原因为：缺失库libgfortran3

  • 解决方法：

  • sudo gedit /etc/apt/sources.list
deb http://gb.archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic main universe #在文本最后加
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大肥猫的主人
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