安装Bioconductor中的包

最新推荐文章于 2024-08-16 13:13:20 发布
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分类专栏： R语言基础
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1. R GUI：在“程序包”——“选择软件库”，选取“bioC software”，之后再“安装程序包”，选择需要安装的包。

2. 先在console中运行命令，setRepositories(addURLs =c(CRANxtras = "http://www.bioconductor.org"))，之后再“安装程序包”，选择需要安装的包。

swuteresa
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自动批量安装加载cran, bioconductor和github三个平台的所有的R包
qq_40073899的博客
05-03 232
自动批量安装加载cran, bioconductor和github三个平台的所有的R包
R语言Bioconductor安装全流程
TianzhouFeng的博客
02-01 2万+
R语言Bioconductor安装全流程 作为一只生物狗，R语言对于生物数据分析真的很重要！如果你翻翻生物专业研究生的朋友圈，你的感觉一定是： 满世界都在学R语言； 满世界都在吐槽R包难装！ 下面给大家分享一下bioconductor包的安装全过程，算是轻度排雷。 准备_Rtools的安装 首先我们必须清楚Bioconductor和R是具有版本对应关系的！我们在着手安装Bioconductor之前一定要前往Bioconductor主页查看与你的R匹配的Bioconductor版本！ 如果你正好使用的是
bioconductor
07-24
本书是国内第一本系统介绍R语言及Bioconductor软件包的图书。Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前，它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具，其中大多数工具对DNA微阵列或基因组芯片数据的处理、分析、注释及可视化的。
install bioconductor packages
u011090052的专栏
11-24 946
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite()
探索生物信息学的视觉乐园：Bioconductor包贴纸项目
gitblog_00093的博客
06-24 355
探索生物信息学的视觉乐园：Bioconductor包贴纸项目 项目地址:https://gitcode.com/Bioconductor/BiocStickers 在数据可视化日益重要的今天，Stickers for some Bioconductor packages 项目带来了一股清新之风，它不仅为枯燥的代码世界增添了色彩，更是连接开发者与用户的创意桥梁。该项目汇集了为生物信息学领域内多个Bi...
Bioconductor 软件包安装到R
weixin_33682790的博客
10-08 235
为什么80%的码农都做不了架构师？>>> ...
R bioconductor包SRAdb下载数据
qq_27390023的博客
06-18 661
序列读数档案（SRA）是最大的来自下一代测序平台的公共测序数据库，包括罗氏454 GS系统、Illumina基因组分析仪、应用生物系统SOLiD系统、Helicos Heliscope和其他。然而，使用目前的工具寻找感兴趣的数据可能是一个挑战。SRAdb试图使访问与提交、研究、样本、实验和运行相关的元数据更加可行。这是通过将所有的NCBI SRA元数据解析成一个可以在本地存储和查询的SQLite数据库来实现的。软件包中的全文检索使元数据的查询非常灵活和强大。可以下载fastq和sra文件在本地进行比对。除了
bioconductor下R包的安装
ziixiaoshenwang的博客
08-12 2823
这种方法不能用了 首先安装BiocManager if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE)) install.packages(“BiocManager”) BiocManager::install(“ballgown”） 安装多个包
bioconductor常用包(GO.db等)安装问题
qq_43340469的博客
04-18 8138
项目场景： 在绘制微生物相互作用网络时，需要用R语言的igraph计算相关的参数。其中需要用到bioconductor的各类包，尤其是WGCNA是函数计算使用的前提。 问题描述 在R4.0.3安装bioconductor的常用包时，所使用的代码是： package_list <- c("digest","AnnotationDbi", "impute", "GO.db", "preprocessCore","WGCNA","multtest") for(p in package_list){ i
Dockerfile: 安装 R 包的方法（包含安装 Github 和 Bioconductor 包） + 安装失败后报错退出 / 判断是否成功安装 R 包
douerw的博客
12-11 2468
前提 若使用传统方法 RUN R -e "install.packages('包')" 来安装R包，安装失败后不会有任何提示且继续进行下一步，执行镜像后出现报错不太友好。 方法 安装后不退出（无法判断是否安装成功） 普通包 添加指定镜像 RUN R -e "install.packages('包'), repos='http://cran.rstudio.com/'" #官方源 RUN R -e "install.packages('包'), repos='https://mirrors.tu
bioconductor安装
07-28
然后可以使用BiocManager包来安装Bioconductor的包，例如： ```R BiocManager::install(c("GenomicRanges", "Organism.dplyr")) ``` 如果需要安装特定版本的BiocManager，可以使用以下命令：\[2\] ```R devtools:...
在R中下载bioconductor的包很慢，而且下载过程中总显示 cannot the connection
weixin_62589345的博客
09-18 1314
在R中下载bioconductor的包很慢，而且下载过程中总显示 cannot the connection
一站式解决R包安装的各种方法及常见问题（Bioconductor、github、手动安装等）
最新发布
qq_51566832的博客
08-16 1369
各种R包安装方式及各种安装问题解决
下载R包问题汇总
weixin_45161743的博客
12-01 9754
下载R包1. 下载方法2. 解决方法汇总 参考链接：https://www.cnblogs.com/lph970417/p/11655371.html 1. 下载方法 install.packages("package_name") 从Bioconductor上下载 library(BiocManager) BiocManager::install("package_name") 从git...
R: R package安装的几种方式
热门推荐
跳动的喵尾巴
05-04 5万+
R包安装方式 一. R官网(CRAN)安装 二. Bioconductor安装 三. Github安装 四. 手动安装 一、CRAN安装 对于大多数R包或可以在R官网上查询到的包，都可以直接进行安装。 直接利用代码安装 install packages("R包的名称") 从R—packages界面搜索安装 在第3不中输入R包名称，检索，点击“Install”进行安装，待安装进度走完，会显示安装成功。 图1 R包安装 从菜单栏—tools中进行安装，出现与图1中相同界面，输入检索并安装即可。
安装 Bioconductor
weixin_41242128的博客
09-21 4649
1.R 中安装 >options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor") >options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) >install.packages("BiocManager") 之后可以随意安装了R包了，依赖问题解决 #library('BiocManager') library('BiocMa
R语言 install.packages 无法读取索引
ForeverNull的专栏
09-24 1万+
R语言 install.packages 无法读取索引问题描述在公司的Centos服务器上安装R的包，总是安装不成功，然后有如下提醒：Warning: 无法在貯藏處https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib中读写索引 Warning message: package ‘DBI’ is not available (for R version 3.2.2)
R 3.6.1 BiocManager 包
sinat_36268769的博客
07-11 1万+
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