生物信息学常见数据格式 • fasta • fastq • gff/gtf

一。fasta

fasta 是一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。其中核酸或氨基酸均以单
个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释
特征: 2行, id行和序列行.
id行以“>”开头, 有时候会包含注释信息
序列行一个字母表示一个碱基/氨基酸
                                        A、T、C、G、N
                                        20种常见氨基酸

二。fastq

 

三。gff/gtf

ls

less -SN example.gtf

zless -SN Homo_sapiens.GRCh38.102.chromosome.Y.gff3.gz

 

• 

  每一行有九列

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