go kegg_GO富集气泡图详解

主要采用clusterProfiler包来进行富集，首先贴一个官方说明clusterProfiler。

在推荐一个clusterProfiler的文章，各种参数都讲的很详细：搜狗搜索引擎 - 上网从搜狗开始..

富集可以有不同的参考基因组，Bioconductor - BiocViews这个网站可以查看有哪些物种的参考基因组，并有下载代码。

首先下载并加载几个R包：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("clusterProfiler")#包的名称换了就可以下载其他的包

library(GOplot)#绘图包

library(clusterProfiler)#采用该包进行富集

library(org.Bt.eg.db)#牛的参考基因组

载入包的时候发生报错（附解决方法）：Error: package or namespace load failed for ‘clusterProfiler’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):

不存在叫‘data.table’这个名字的程辑包