cytoscape要求的JAVA版本_微生物研究必备：Cytoscape绘制网络图（一）

原标题：微生物研究必备：Cytoscape绘制网络图(一)

Cytoscape

是一个专用于互作网络数据可视化的软件。在微生物研究领域，通过对不同样本间的物种丰度信息进行相关性分析，可以获得物种在环境样本中的共存在关系，得到物种在同一环境下的相互作用的情况，进一步解释样本间表型差异的形成机制。

实例来一波~

⏩在一些影响因子较高的文章中，经常可以见到Cytoscape绘制的高颜值网络图。

1、如我们去年发表的强直性脊柱炎的肠道微生物标记物研究文章，对强直性脊柱炎患者组(蓝色圆圈)和健康组(红色圆圈)中鉴定出12个MGSs进行网络相关性分析。结果显示，在强直性脊柱炎患者组的MGSs与健康组的MGSs之间呈负相关关系(红线)，组内富集细菌之间呈正相关关系(蓝线)：