打开 igv java_【2019-04-23】 IGV打不开的处理办法

最新推荐文章于 2022-04-26 21:25:56 发布
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版权

IGV：Integrative Genomics Viewer

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IGV官网

http://software.broadinstitute.org/software/igv/home

The Integrative Genomics Viewer (IGV) is a high-performance visualization tool for interactive exploration of large, integrated genomic datasets. It supports a wide variety of data types, including array-based and next-generation sequence data, and genomic annotations.

来自官网的简介，总而言之，IGV是一个很棒的基因组可视化软件，最常见的使用场景是可视化查看比对结果。

在官网点击下载安装，一气呵成。

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downloads

满心欢喜的点击桌面的快捷方式，结果，什么事情都没有发生。

Excuse me?

重复三次，依旧没有反应。从快捷方式打开IGV本体所在的文件夹

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IGV文件夹

快捷方式指向

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马渊程
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打开 igv java_必备可视化Integrative Genomic Viewer(IGV)
weixin_30124601的博客
02-26 1207
你会用到的网站：写在前面：之前mac不小心升级了一下java，然后igv就不能用了，要写教程必须降级java首先，看官方说明，需要安装Java -8，9以上版本不支持。我的mac不知道什么时候更新到了java 10，按说可以向下兼容，但是事与愿违，igv不能正常使用了。需要降级Java，mac用户可以直接参考，windows可以试下直接下载安装IGV：先删除原来的javaterminal打开终端，...
linux运行igv报错,IGV 哐当就不能用了，除了换台电脑还能怎么办？
weixin_36220492的博客
05-05 862
不知道哪一次更新，也不知道因为更新了什么，PC 上的 IGV 突然就不能用了。除了换一台 Mac 以外还能怎么办。下文记录了 debug 的过程以及一点思考。前奏IGV 这个工具因为是 Java 全平台适配的，一般不太容易出现 bug。在 Windows 上常见的问题是由于 Java 32位和64位版本问题造成的。在 64 位的电脑上安装了 32 位的 Java(通常默认就是32位)后，如果给 I...
mac版 IGV(版本2.12.3)安装
ACGTexplorer的博客
04-26 1805
安装了近2个小时,一直出现的问题就是没有报错,就是点图标无反应,一度想放弃,但终于柳暗花明! 之前电脑安装过,但因为电脑之前升级, 基本格式化, 之前的软件环境都没了 网上搜解决方法未果. 因为软件应该没问题,就考虑是Java的问题. 最开始安装的Java8(比较久版本的IGV对应version 8), 点图标无反应; 配置环境变量后仍不行, 考虑可能是Java版本的问题, 搜IGV官网也没有说明具体对应的是哪个版本的, 是在老版本的页面发现的 需要提前安装Java, 最新版的IGV需要Java11, 官
打开 igv java_IGV加载很久很烦人？三步帮你解决！
weixin_42515101的博客
02-26 1410
刘小泽写于19.10.28相信大家都遇到过，这个烦人的loading~烦人的loading这是因为IGV的设计者默认全球都能访问他们的网站，但是，广大的国内用户做不到啊！IGV启动每次都要加载一下基因组和注释文件，我们每次都要在loading上面浪费大量的时间，那么这个问题怎么破？思前想后，我认为这个是一条最快的途径第一步 断网网络是loading的根源，断了网，它想访问也没用第二步 重新打开IG...
玩转基因组浏览器之IGV展示bam文件
庐州月光的博客
02-26 9859
欢迎关注”生信修炼手册”!bam文件记录了reads比对到参考基因组的详细信息，是NGS分析中的核心文件。该文件是一种二进制的格式，通常我们只能借助samtools这种特定的工具来转换成...
Python库 | igv_reports-0.9.0-py3-none-any.whl
02-16
python库，解压后可用。 资源全名：igv_reports-0.9.0-py3-none-any.whl
IGV_Win_2.5.3-installer.exe
07-20
必备可视化Integrative Genomic Viewer(IGV) 需要降级Java，mac用户可以直接参考，windows可以试下直接下载安装IGV
PyPI 官网下载 | igv_reports-0.9.0-py3-none-any.whl
01-05
资源来自pypi官网。 资源全名：igv_reports-0.9.0-py3-none-any.whl
IGV.rar_IE 插件_IE插件_IGV_ie plugin_插件
09-23
一个精美的IE插件
igv-reports:Python应用程序生成独立的igv.js页面，可以使用“文件”协议在浏览器中打开该页面
05-07
igv-reports需要Python 3.6或更高版本以及pip 。 与所有Python项目一样，建议使用虚拟环境。 遵循有关使用conda创建虚拟环境的说明。 1.从安装Anaconda 2.创建一个虚拟环境 conda create -n myenv python=3.7.1 ...
IGV使用说明
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Baimoc
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linux中IGV的运行,[Linux] IGV使用说明
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IGV（Integrative Genomics Viewer）是一个高性能的可视化工具，可以交互式的察看综合的基因组相关数据，友好的支持多种数据类型，包括芯片、二代测序和基因组注释数据等。IGV是基于Java的工具，且在不断更新当中，不同版本的IGV可能需要不同的Java版本。
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为了准确判断线框内是否有托盘，需要对线框进行识别定位，以判断车体与线框（一般是黄色四边形，如下图所示）的相对位置，以便进行后续操作。 仓储环境中，目标受光照影响不大，所以框体颜色特征可以采用，此外由于框体的形状特征、大小特征明显，根据特征融合的思想，可以增强识别框体算法的鲁棒性。 一、基本概念 1. 轮廓 (contours) 轮廓可以简单认为成连续的点（连着边界）连在一起的曲...
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