打开 igv java_必备可视化Integrative Genomic Viewer(IGV)

本文指导如何在Mac上降级Java以运行IGV,提供了删除旧Java版本的命令,并介绍了IGV作为基因组数据可视化工具的功能,包括BAM/SAM格式支持、基因注释、自定义基因组和查看测序深度等操作。
摘要由CSDN通过智能技术生成

你会用到的网站:

写在前面:

之前mac不小心升级了一下java,然后igv就不能用了,要写教程必须降级java首先,看官方说明,需要安装Java -8,9以上版本不支持。我的mac不知道什么时候更新到了java 10,按说可以向下兼容,但是事与愿违,igv不能正常使用了。

需要降级Java,mac用户可以直接参考,windows可以试下直接下载安装IGV:先删除原来的javaterminal打开终端,复制粘贴一下三条命令:sudo rm -fr /Library/Internet\ Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin

sudo rm -fr /Library/PreferencesPanes/JavaControlPanel.prefPane

sudo rm -fr ~/Library/Application\ Support/Java⚠️:不要通过/usr/bin 删除 Java 工具来卸载 Java。此目录是系统软件的一部分,下次对操作系统执行更新时,Apple 会重置所有更改。

finder中进入 /Library/Java/JavaVirtualMachines,然后删除之前的jdk.版本号

【Windows用户下载,解压后,点击igv.bat文件即可启动;如果启动失败,用记事本打开并编辑igv.bat文件,在文件的最后新起一行输入pause,保存后,再尝试打开,就可以在Windows下的命令行界面(cmd命令提示符)看到错误信息,再根据信息提示去解决问题;不过一般问题不大】

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值