gwas snp 和_高分GWAS文章解析

摘要：

木豆(Cajanus cajan)是一种低摄入需求的热带谷类豆科植物，在亚洲，非洲和热带美洲发展中国家提供食物和营养安全方面有重要作用。292份木豆材料进行全基因组重测序，我们得到了全基因组变异。通过选择消除分析，我们发现与驯化和育种有关的基因组区域。使用全基因组关联分析，我们确定农艺重要性状相关的几个候选基因。在木豆中这些性状的候选基因与其他植物中开花时间控制，种子发育和荚开裂基因具有序列相似性。这个发现将会加速关键性状的遗传改良，以提高木豆的产量和可持续性。

Whole-genome resequencing of 292 pigeonpea accessions identifies genomic regions associated with domestication and agronomic traits

2017.7 Nature genetics

研究材料：292个品系，包括117个育种品系、166个地方品种2个其他品种和3个野生种中的7个品系。

测序策略: PE建库，Hiseq2500测序，测序平均深度5-12X

结果：

1.木豆材料的重测序和变异类型

对292份材料(图1a)重测序，用BWA与木豆的参考基因