tRNAscan-SE

    tRNAscan-SE是一款可以在基因组上扫描tRNA的序列，也就是说你给定一组基因序列（fasta数据格式），可以用这个软件去预测这个序列是不是tRNA.具体的实现原理，我不搞生物，所以也就不太明白。tRNAscan-SE是在linux下运行的。

   tRNAscan-SE有两种使用方法。

   1）tRNAscan-SE的网页版（http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE），但是可能不方便也有一些文件大小限制。

   2）tRNAscan-SE的本地安装。通过下载package，直接在linux运行环境下安装该环境。

       步骤：

•        $ wget http://lowelab.ucsc.edu/software/tRNAscan-SE.tar.gz
•        $ tar zxf tRNAscan-SE.tar.gz
•        $cd tRNAscan-SE-1.3.1
  
•        $ make && make install
•        $ make testrun

   

    这样就说明软件配置成功！

    现在就开始预测一段基因序列࿱