2020.11.12丨tRNAscan-SE-2.0最新安装流程

• 最近接了一些细菌和真菌做RNA-seq的项目，有客户提到想要获取核糖体RNA（tRNA）的统计结果，之前用sortmerna一个样品都要比对4，5个小时，打算试试tRNAscan-SE。不过安装过程卡了半天，一是官网没有安装说明，二是该软件的安装教程最新也是2017年的，版本和安装方式已经发生了变化。特此写下这篇文章，作为记录。
• 软件名称：tRNAscan-SE
• 官网地址：tRNAscan-SE Search Server (ucsc.edu)
• 下载链接：tRNAscan-SE-2.0.7.tar.gz (ucsc.edu)
• 对文件进行解压缩：
  • gunzip trnascan-se-2.0.7.tar.gz
  • tar -vxf trnascan-se-2.0.7.tar
• 这里就是卡住的点，其他教程说的需要手动或者命令行修改Makefile文件里的$HOME路径，实际上在2.0版本中Makefile不仅有两个文件（.in .am，./configure后会生成Makefile）而且也无法在里面修改路径。2.0版本无需考虑安装包的所在路径，直接按照使用GNU的AUTOCONF和AUTOMAKE产生的程序的安装步骤走就可以（参考：Linux 命令详解./configure、