单细胞转录组学中，除了表达信息，RNA velocity也被用于预测细胞发育路径。RNA velocity通过区分未剪接和已剪接mRNA来估计基因表达状态的变化率。本文介绍了velocyto工具及相关概念，如mRNA半衰期，并提及在不同环境中安装相关软件遇到的问题和解决方案。
单细胞转录组确实是利器，但我们大多只利用了表达的信息，而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。
最近nature发了一篇单细胞方法类文章，讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。
velocyto-notebooks
首先需要了解一些基本概念：
RNA velocity：the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between unspliced and spliced mRNAs in common single-cell RNA sequencing protocols. a high-dimensional vector that predicts the future state of individual cells on a timescale of hours. 比较抽象，一开始很难理解。
half-life of mRNA：Translation in both prokaryotes and eukaryotes involves three phases: initiation, elongation, and termination. The relative a
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