TCGA三个在线可视化网站

最新推荐文章于 2024-05-19 21:04:56 发布
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文章标签： 数据库

1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org

整合和简化了包括TCGA，ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容，提供友好可视化的界面，可供下载。

主要展示基因的somatic 突变谱，拷贝数变化，mRNA&miRNA表达量变化，DNA甲基化以及蛋白质表达的情况，并结合患者的临床资料，展示了KM生存曲线。

2.>OncoLnc: www.oncolnc.org

这是一个整合了TCGA的各种RNA数据和患者临床数据，提供生存分析的网站，灰常简单好用。

3.>MEXPRESS:mexpress.be/about

整合了TCGA中的DNA甲基化，表达量及临床数据，主要用来探索甲基化，基因表达和临床表型之间的关联，看界面也很友好

weixin_33755649
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下载TCGA数据用，这个优点我觉得在于下载数据的实时性有保证，并且它也是从官网下载的，最主要它支持断点下载。。。就算你网再不稳定。。睡一觉总能下好了
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tcga官方下载工具 最近服务器不稳定 有时候下载很慢 如果很难下载可以试试从这里下载
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