ncbi查找目的基因序列_献给初学者：如何使用 NCBI 查找基因序列、mRNA、Promoter...

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有不少人询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用 BLAST 进行序列比对......其实这些问题在 NCBI 上都可以方便的找到答案。

我将结合我自己使用 NCBI 的一些经历跟大家交流一下 NCBI 的使用。主要有以下四部分内容：如何查找基因序列、mRNA、Promoter

如何查找连续的 mRNA、cDNA、蛋白序列

运用 STS 查找已经公布的引物序列

如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性

今天我们就先讲第一部分：如何查找基因序列、mRNA、Promoter。这里主要用到的是 Map viewer，我们以人的 IL6(白细胞介素 6)为例讲述一下具体的操作步骤。

1. 打开 Map viewer 页面

在 search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的基因。操作完毕如下图所示：

2. 点击 GO 出现如下界面：

3.在步骤 2 图示的右下角有一个 Quick Filter，在 Gene 前面的小方框里打勾，然后点击 Filter。出现下图:

染色体上的红色区域即为你的目的基因所处位置。下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的。经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。尽管你分别点击后，序列代码等有所差异，但碱基基本