FigDraw 11. SCI 文章绘图之小提琴图 (ViolinPlot)

最新推荐文章于 2025-07-08 20:00:00 发布

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#r语言 #数据挖掘 #数据分析

本教程详细介绍了如何使用R语言的ggplot2包绘制小提琴图，从基本的图表绘制到复杂的数据可视化，包括水平小提琴图、添加统计值、组合小提琴图、云雨图等。教程还涉及了ggstatsplot包的使用，用于创建带有统计检验信息的图形，帮助科研人员更好地理解和展示数据分布。

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桓峰基因公众号推出基于R语言绘图教程并配有视频在线教程，目前整理出来的教程目录如下：

前言

小提琴图 (Violin Plot)是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度，是优于箱线图的一种统计图形。他结合了箱线图与密度图，箱线图位于小提琴图内部，两侧是数据的密度图，能显示出数据的多个细节，而学会软件来绘制精美的小提琴图，则是科研中必备的手段。

为了使数据表达更加丰富，同时将小提琴图与箱线图和误差条图相结合。另外，当每个组别有两个属性变量时，分半的小提琴图可节省绘图空间，同时更美观。为了突出小提琴图表达数据的优越性，常规的条形图结合误差条图也被绘制。小提琴图(Violin Plot)用于显示数据分布及其概率密度，因其形状酷似小提琴而得名。

这种图表结合了箱线图和密度图的特征，主要用来显示数据的分布形状。中间的黑色粗条表示四分位数范围，从其延伸的幼细黑线代表95% 置信区间，而白点则为中位数。如果需要，中间的箱线图还可以替换为误差条图。

箱线图或误差条图在数据显示方面受到限制，简单的设计往往隐藏了有关数据分布的重要细节。例如使用箱线图时，我们不能了解数据分布是双模还是多模。小提琴图能够展示数据的真正分布范围和形状。值得注意的是，虽然小提琴图可以显示更多详情，但它们也可能包含较多干扰信息。

软件包安装

R语言使用ggplot2工具包绘制小提琴图,此外还有ggpubr和高颜值绘图软件包ggstatsplot，安装并加载，如下：

if (!require(ggplot2)) install.packages("ggplot2")
if (!require(ggpubr)) install.packages("ggpubr")
if (!require(ggstatsplot)) install.packages("ggstatsplot")
library(ggplot2)
library(ggpubr)
library(ggstatsplot)

数据读取

我们使用两套数据集，包括 mpg 和 iris，例子中大家稍微注意下，主要时因为分组的不同，需要选了不同的数据集。数据读取如下：

data(mpg)
mpg$year <- as.factor(mpg$year)
head(mpg)
## # A tibble: 6 x 11
##   manufacturer model displ year    cyl trans      drv     cty   hwy fl    class 
##   <chr>        <chr> <dbl> <fct> <int> <chr>      <chr> <int> <int> <chr> <chr> 
## 1

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