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临床预测模型构建统计学分析方法
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临床预测模型构建统计学分析方法
桓峰基因
这个作者很懒,什么都没留下…
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Topic 20. 临床预测模型之竞争风险模型及计算生存概率
构建竞争风险模型及计算生存概率原创 2022-10-16 14:58:31 · 2871 阅读 · 0 评论 -
Topic 19. 临床预测模型之输出每个患者列线图得分 (nomogramFormula)
临床列线表构建完成,怎么输出列线表每个患者总的得分?关注桓峰基因,保姆级教程,快来学习吧!原创 2022-10-14 11:24:12 · 4897 阅读 · 11 评论 -
RNA 24. SCI文章中基于TCGA的免疫浸润细胞分析的在线小工具——TIMER
基于TCGA的免疫浸润细胞分析在线小工具——TIMER原创 2022-07-19 17:18:47 · 1494 阅读 · 0 评论 -
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SCI文章中表达基因Cox模型的风险因子关联图(ggrisk)原创 2022-07-10 20:52:21 · 1268 阅读 · 0 评论 -
RNA 20. SCI 文章中单样本免疫浸润分析 (ssGSEA)
RNA 20. SCI 文章中单样本免疫浸润分析 (ssGSEA)近一年发文量最高的方法之单样本免疫浸润分析 (ssGSEA)原创 2022-06-23 08:13:44 · 10281 阅读 · 0 评论 -
Topic 18. 临床预测模型之缺失值插补方法
Topic 18. 临床预测模型之缺失值插补方法总结最全面的临床数据缺失值插补方法原创 2022-06-06 12:07:22 · 5488 阅读 · 0 评论 -
Topic 17. 临床预测模型之缺失值识别及可视化
Topic 17. 临床预测模型之缺失值识别及可视化如何处理缺失值——识别缺失值及可视化原创 2022-06-05 22:17:44 · 1485 阅读 · 0 评论 -
Topic 16. 临床预测模型之接收者操作特征曲线 (ROC)
全网总结最全的ROC绘制方法,总有一款适合您!原创 2022-04-09 13:29:50 · 4080 阅读 · 2 评论 -
Topic 11. SCI中多元变量筛选—单/多因素表
单因素和多因素这里有时也会很困惑,在分析中也同样会遇到很多问题,比如当做单因素分析时,得到的 P 值显著,但是在做多因素时却不显著?又比如多因素分析时,选择变量的个数不同,得到的 P 值完全不同,显著的变量反而不显著,各种疑惑,一头雾水,这些问题该怎么解决呢?我感觉每个项目在做多因素分析的时候我都需要尝试十几次变量筛选,其目的就一个希望自己研究的那个因素能够被挑选出来,成为一个独立的预测因子,想必你也有同样的想法吧!原创 2022-01-19 10:51:15 · 2438 阅读 · 9 评论 -
Topic 7. 临床预测模型--Cox回归
上期讨论完两种建模方式,这期讲一下经典的 Cox 回归,这个估计大家早就很熟悉了,但是这里还是需要梳理一下到底该怎么使用。原创 2022-01-12 14:09:35 · 7261 阅读 · 0 评论 -
Topic 10. 单因素 Logistic 回归分析—单因素分析表格
上期学习了怎样汇总单因素 Cox 回归的结果,这期学习单因素;回归分的汇总,由于使用的是 coxph和 glm 两个函数结果的展示有所不同,因此整理过程略有不同,但是提取的信息是一致的。原创 2022-01-17 10:40:36 · 10785 阅读 · 2 评论 -
Topic 8. 临床预测模型-Lasso回归
Lasso回归在决定哪些因素可以纳入模型提高模型的稳健性,以及相应的给出各种可用图表,在做生物标志物筛选时,效果非常好!原创 2022-01-13 15:33:04 · 9842 阅读 · 1 评论 -
Topic 6 SCI 文章之计数变量泊松回归
这期继续说说统计这些事,泊松分布大家可能熟悉些,但是用它来做模型还是需要细细品味一下。原创 2022-01-11 10:24:05 · 4902 阅读 · 0 评论 -
Topic 5. SCI 文章之样本量确定及分割
每次做方案设计的时候,都会涉及到一个尖锐的问题,客户会问我得用多少的样本量才能发文章,这个嘛,事情从理论上回答还是有依据的,但是从实际出发永远都是 “理想很丰满,现实很骨感”。不过还是需要从理论上来分析一下,自己需要多少的样本适合构建临床预测模型。原创 2022-01-10 09:34:46 · 3002 阅读 · 0 评论 -
Topic 9. SCI 文章第二张表—单因素回归分析表
在SCI论文中,我们经常可以看见一些这样的表格,大多数命名表格 2.,主要用来表示原因和结果的单因素分析的关系或者是分组变量的关系,也就是单因素分析,那这样一张表格该怎么完成呢?原创 2022-01-15 16:33:09 · 3437 阅读 · 8 评论 -
Topic 2. 生存分析之 Kaplan-Meier
关于生存分析,这个大家都非常熟悉,也是临床研究的最最常用的方法,但是在使用过程中,无论是医生还是分析人员对它都有点迷糊,下面我整理的最全的关于生存分析方法的方方面面的知识点,并结合实际的TCGA数据库结果来展示用法,希望能够帮助大家理解其使用的方法和技巧。原创 2022-01-06 15:40:56 · 3170 阅读 · 0 评论 -
Topic 3. SCI文章第一张表格--基线表格
SCI文章制作第一张表格--基线表原创 2022-01-06 10:10:12 · 5429 阅读 · 0 评论 -
Topic 1. 临床标志物生信分析常规思路
最近搞了几个模型,顺便就整理了一些关于临床预测模型构建的方法,当然书籍和网络上也能获得这些资源,但是我们将结合 TCGA 和 GEO 等 NGS 的数据来讲解,比如我们在做多组学分析的分组差异之后,对筛选之后的差异突变基因,或者差异甲基化基因,又或者差异表达基因,lncRNA,microRNA,miRNA,以及各种类型的 Signitures 结合临床信息来构建临床预测模型等,目前做过的大概就这些。原创 2022-01-06 15:47:35 · 1838 阅读 · 0 评论 -
Topic 4. 临床预测模型构建 Logistic 回归
上期我们已经基本了解变量的类型,以及如果处理不同种类的变量,现在我们就来学些一个临床预测模型--GLM 广义线性模型及 R 语言实现。原创 2022-01-07 14:15:19 · 5425 阅读 · 0 评论 -
Topic 13. 临床预测模型之一致性指数 (C-index)
全网最全 C-index 汇总原创 2022-03-22 14:58:12 · 18577 阅读 · 4 评论 -
Topic 12 临床预测模型之列线表 (Nomogram)
临床上列线表已经占据大样本临床研究的半壁江山,非常流行!原创 2022-03-21 19:09:56 · 12189 阅读 · 0 评论 -
Topic 15. 临床预测模型之决策曲线 (DCA)
全网最全决策曲线绘制方法 DCA原创 2022-03-24 22:25:28 · 15192 阅读 · 9 评论 -
Topic 14. 临床预测模型之校准曲线 (Calibration curve)
全网总结最全的校准曲线 Calibration curve原创 2022-03-23 13:17:02 · 27226 阅读 · 6 评论