rdkit 同一个化合物的多种SIMLES格式生成；片段分子 两个R-groups基团字符串拼接

已于 2022-10-30 12:12:16 修改
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分类专栏： 知识点 CADD/AIDD 文章标签： rdkit smiles
于 2022-10-22 17:23:32 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/127464106
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本文介绍了如何使用rdkit库来生成同一个化合物的多种SIMILES格式，通过设置doRandom参数为True可以得到不同版本的SMILES。同时，文章探讨了片段分子的两个R-groups基团字符串拼接问题，特别是在处理星号(*)作为连接点时的注意事项，建议通过rdkit接口选取合适的位置进行对接，并给出了简单的对接方法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1、rdkit 同一个化合物的多种SIMLES格式生成

Chem.MolToSmiles(mm, doRandom=True)，doRandom=True加上即可
mm = Chem.MolFromSmiles('[*]C(=O)O')

smis,mols=[],[]
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