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原创 【论文笔记】关系感知异构图Transformer 双通道

识别新型药物-药物相互作用(DDI)近年来,出现了多种基于网络的技术来预测DDI。然而,主要关注DDI相关网络内的局部结构,往往忽视了从全局角度看待药物节点之间间接连接的重要性。此外,有效处理生物医学知识图和药物分子图中的异构信息仍是提高DDI预测性能的一个挑战。为了解决,本文提出了一种基于Transformer的关系感知图表示学习框架(TIGER)。1.使用架构有效地利用异构图的结构,使其能够直接学习长依赖和高阶结构。2.结合了关系感知的自注意力机制。

2024-07-03 18:49:56 820

原创 【矩阵论】6.总结3

定义9.1给定矩阵A∈Rm×nA∈Rm×n, 若存在矩阵X∈Rm×mX∈Rm×m满足下面四个方程(Penrose-Moore 方程组1AXAA;(1)AXA=A;1AXAA;2XAXX;~~(2)XAX=X;2XAXX;3AXTAX3AXTAX4XATXA4XATXA则称XXX为AAA的一个广义逆矩阵定理 4.1.3。

2024-06-11 10:52:09 698

原创 【矩阵论】6.总结2

6. 总结24. 矩阵分解 两个矩阵 LU分解 QR分解 满秩分解 奇异值分解LU 分解 (Gauss消去法,待定系数法 )在 Gauss 消去过程中有A=L1−1L2−1⋅⋅⋅Ln−1−1A(n).\mathbf{A}=\mathbf{L}_1^{-1}\mathbf{L}_2^{-1}\cdotp\cdotp\cdotp\mathbf{L}_{n-1}^{-1}\mathbf{A}^{(n)}.A=L1−1​L2−1​⋅⋅⋅Ln−1−1​A(n). Li−1=[1⋱1li+1,i1…⋱ln,i

2024-06-11 10:51:55 359

原创 【矩阵论】6.总结1

6. 总结11. 等价标准形 行列式因子 不变因子 初等因子 Jordan标准形 最小多项式等价 A(λ)≅B(λ)\boldsymbol A(\lambda)\cong \boldsymbol B(\lambda)A(λ)≅B(λ) 的充要条件存在 mmm 阶可逆 λ\lambdaλ 阵 P(λ)\boldsymbol P(\lambda)P(λ) 与 nnn 阶可逆 λ\lambdaλ 阵 Q(λ)\boldsymbol Q(\lambda)Q(λ),使 B(λ)=P(λ)A(λ)Q(λ).\bo

2024-06-11 10:51:35 283

原创 【矩阵论】5.复合矩阵

设AAA是m×nm\times nm×n矩阵. 定义Qkmi1ik∣1≤i⋯ik≤nQkm​{(i1​ik​∣1≤i⋯ik​≤n对于1⩽k⩽min⁡mn1⩽k⩽minmn, 定义AAA的kkk级复合矩阵CkAC_k(A)Ck​ACkAC_k(A)Ck​A是mk×nkkm​×kn​矩阵,它分别以α∈Qkmα∈Qk。

2024-05-13 17:28:53 1054

原创 【矩阵论】4.广义逆矩阵

4. 广义逆矩阵在线性代数里,对于线性方程组 Ax=bAx=bAx=b ,如果方阵AAA是非奇异的,则存在唯一的 AAA 的逆矩阵 A−1A^{-1}A−1, 满足等式 AA−1=A−1A=E,AA^{-1}=A^{-1}A=E,AA−1=A−1A=E, 从而该线性方程组具有唯一的解 x=A−1bx= A^{- 1}bx=A−1b .逆矩阵具有许多良好的性质和用途.遗憾的是,现实经常遇到奇异方阵或 m×n(m≠n)m\times n(m\neq n)m×n(m=n) 的长方形矩阵 AAA . 对于这

2024-05-13 15:09:03 907

原创 【矩阵论】1.方阵函数

1. 方阵函数1.1 方阵函数的定义首先我们定义一些符号方便使用。定义 1.1.1 特征多项式 χA(λ)=∣λE−A∣\chi_A(\lambda)=|\lambda E-A|χA​(λ)=∣λE−A∣ 的根系(连重数)称为方阵 AAA 的 谱 SpecA\mathrm {Spec}ASpecA.mA(λ)m_A(\lambda)mA​(λ) 的根系(连重数)称为方阵 AAA 的 简谱 RspecA\mathrm{Rspec}ARspecA.定义 1.1.2 设 fff 是任一函数 ( 有后面所

2024-05-13 00:24:56 644

原创 【矩阵论】0.准备知识

λ\lambdaλ 矩阵的标准形 Jordan标准形元素为常数的矩阵为数字矩阵。定义 1.1 元素为 λ\lambdaλ 的多项式的矩阵称为 λ\lambdaλ 矩阵 A(λ)A(\lambda)A(λ)。A(λ)A(\lambda)A(λ) 所有元素的最高次数为 A(λ)A(\lambda)A(λ) 的次数,mmm 次 λ\lambdaλ 矩阵 A(λ)A(\lambda)A(λ) 可表示为A(λ)=λmA0+λm−1A1+⋯+λAm−1+AmA(\lambda)=\lambda^mA_0+\lam

2024-05-12 10:21:39 428 2

原创 【矩阵论】3.矩阵分解

3 矩阵分解3.1 三角分解( LU 分解)定义 3.1.1 给定矩阵 A∈Rn×nA\in\mathbb{R}^{n\times n}A∈Rn×n , 若存在下三角矩阵 L∈Rn×nL\in\mathbb{R}^{n\times n}L∈Rn×n 和上三角矩阵 U∈Rn×nU\in\mathbb{R}^{n\times n}U∈Rn×n 使得 A=LUA=LUA=LU , 这种分解称为矩阵的一个三角分解,又称 LULULU 分解。(Gauss消去法,待定系数法 )定理 3.1.2 给定矩阵 A∈Rn

2024-04-28 09:40:40 769 1

原创 【矩阵论】2.矩阵方程

2 矩阵方程2.1 矩阵直积(张量积)定义 2.1.1 设 AAA , BBB 分别是 m×nm\times nm×n 阵和 p×qp\times qp×q 阵,定义A⊗B=(a11B⋯a1nB⋮⋮am1B⋯amnB).\left.A\otimes B = \left(\begin{matrix}a_{11}B&\cdots&a_{1n}B\\\vdots&&\vdots\\a_{m1}B&\cdots&a_{mn}B\end{matrix}\right.

2024-04-22 13:36:42 692 1

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