schrodinger 薛定谔安装与卸载

文章提供了薛定谔软件在Windows和Linux平台的详细安装步骤,包括从百度云下载,解压,运行setup.exe安装,应用patch以及卸载时的命令行操作。对于Linux用户,特别提示了安装路径应改为个人家目录并使用patcher进行补丁处理。

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schrodinger 薛定谔安装

Windows 版

百度云
链接:https://pan.baidu.com/s/107a4KMHMvg1vrXTFHnGcWw
提取码:c6t4

安装步骤
download所有压缩包,解压任意一个压缩包即可(压缩包之间是相互关联的)。
进入解压的后的文件夹,找到setup.exe,双击运行,可以安装到任意盘上,安装路径不要带中文。(建议默认安装)
安装完成后点ok,而不是configure。
找到patch文件,将其复制到软件的根目录(安装目录),并双击打开,后点patch完成。(解压patch.rar获得patch.exe)

Linux 版

百度云
https://pan.baidu.com/s/1Duh4GsoytIklvZp7TdHpWg
密码: wmr1

安装步骤
进入 Schrodinger_Suites_2021-2_Linux-x86_64
sudo ./INSTALL
遇到让你 填 /scratch 的目录到时候,记得改到自己的家目录下
比如我,就改成了 /home/zdx/scratch, 记得先 mkdir /home/zdx/scratch
中间按默认的来即可,安装目录要改到你自己的家目录下,不要使用默认的安装目录!
比如我的,就是 /home/zdx/opt/schrodinger2021-2
跳出的界面,让你放license的,直接关掉。
安装完,把 patcher 拷贝到安装目录
安装目录默认是 /opt/schrodinger/suites2021-2
我的安装目录是 /home/zdx/opt/schrodinger2021-2
sudo ./patcher
点击Patch即可。

启动程序,进入安装目录

./maestro

薛定谔卸载

找到Maestro 2022-2安装的位置

sudo find / -name schrodinger2022-2

删除安装文件夹

sudo rm -rf /opt/schrodinger2022-2
### 安装薛定谔方程相关的模拟器或教育软件 #### 准备工作环境 为了在 VMware 中成功安装量子物理或薛定谔方程相关的模拟器或教育软件,需先准备适当的操作系统镜像文件。通常建议使用 Linux 发行版作为操作系统平台,因为许多科学计算工具在此类平台上支持更好。 #### 下载所需软件包 对于薛定谔方程的研究和教学目的而言,可以考虑下载如下几种开源项目之一: - **Quantum Espresso**: Quantum ESPRESSO 是一套用于电子结构计算和材料科学研究的集成工具集[^1]。 - **NWChem**: NWChem 提供广泛的分子动力学功能,并能够处理从简单体系到复杂生物系统的各种情况。 这些程序都提供了详细的文档指导用户完成编译过程;如果希望简化部署流程,则可以选择预构建好的虚拟机映像版本。 #### 创建新的虚拟机实例 启动 VMware Workstation 或 Player 后创建一个新的客户机配置向导,选择自定义硬件设置以确保分配足够的资源给即将运行的应用程序(特别是内存大小)。接着指定之前获取到的 ISO 文件作为初始引导介质并按照提示逐步前进直至结束整个建立环节。 #### 配置网络连接方式 为了让新搭建起来的小型实验室具备联网能力以便后续更新组件或是访问在线资料库,应该调整其网卡属性为桥接模式(Bridged),这样做的好处是可以让宿主机所在局域网内的其它设备识别该来宾OS就像一台独立存在的计算机一样。 #### 执行安装命令序列 一旦进入目标Linux发行版之后就可以着手于实际应用层面的工作了。这里给出一段Python脚本用来自动化地拉取依赖项以及克隆特定仓库中的源码树: ```bash #!/bin/bash sudo apt-get update && sudo apt-get install -y git gfortran libblas-dev liblapack-dev python3-pip cmake pip3 install numpy scipy matplotlib scikit-learn pandas jupyterlab git clone https://github.com/QEF/q-e.git ~/quantum-espresso cd ~/quantum-espresso; ./configure --prefix=/usr/local/quantumespresso ; make all install ``` 上述指令适用于基于Debian系谱系的操作系统如Ubuntu, 若采用RedHat家族成员则应相应替换`yum`或其他包管理工具执行相似操作。 通过以上步骤可以在VMware环境中顺利架设起一个适合开展有关薛定谔方程数值求解工作的科研工作站。
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