诱导契合对接（Induced Fit Docking）

使用薛定谔软件进行InducedFitDocking柔性对接分析
原创 已于 2023-04-22 14:57:26 修改 · 1.7k 阅读 · 1 ·
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#机器学习 #人工智能

于 2023-04-21 13:04:34 首次发布
InducedFitDocking是一种考虑受体和配体构象变化的柔性对接方法，常用于精确模拟分子识别。在薛定谔软件中，该模块自动处理格点文件，以1IEP为例，展示了Nilotinib配体在柔性对接中得分较高的情况，表明计算过程中的构象变化对结果有显著影响。

诱导契合对接（Induced Fit Docking）

在半柔性对接中，配体的构象允许发生一定变化。在柔性对接中，受体和配体构象均可发生变化。
打开薛定谔软件中的Induced Fit Docking模块做柔性对接，格点文件会自动生成，此处省去配体准备，以1IEP为例。


柔性对接一般用于精确考虑分子间的识别情况。由于计算过程中体系的构象可以变化，所以计算耗费最大。相比半柔性对接，Nilotinib配体的对接打分在柔性对接中偏高。

Maestro 薛定谔软件简单分子对接案例
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