不是maf格式的somatic突变数据就没办法读入到maftools了么

        因为使用的是百度李彦宏的文章数据，大家会比较倾向于处理tcga的肿瘤突变数据，虽然仅仅是输入数据的不一样，后续分析都是靠 maftools 这个包，maftools 全能无需我再吹嘘，必须花十几个小时认真掌握它！

        假如大家是在 https://xenabrowser.net/datapages/ ，找到   GDC TCGA Breast Cancer (BRCA) (20 datasets) ，数据库提供了4种somatic突变的maf文件供下载，somatic mutation (SNPs and small INDELs) ，一般来说我们选择GATK团队出品的MuTect2 软件拿到的somatic突变数据文件；

• MuTect2 Variant Aggregation and Masking (n=986) GDC Hub

这个时候呢，你会发现下载的突变数据是tsv格式，并不是maf格式，读入这样的tsv格式的肿瘤突变是信息需要一定技巧哦！

Data from different samples is combined into mutationVector; "Hugo_Symbol", "Chromosome", "Start_Position", "End_Position", "Reference_Allele", "Tumor_Seq_Allele2", "Tumor_Sample_Barcode", "HGVSp_Short" and "Consequence" data are renamed accordingly and presented; "dna_