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mutagene是一个肿瘤突变频谱数据库,从ICGA, TCGA等肿瘤项目中收集整理蛋白编码基因上的体细胞突变数据,分析识别对应的突变频谱,对应的文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下
https://academic.oup.com/nar/article/45/W1/W514/3796332
网址如下
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/mutagene/
通过Explore
菜单,可以查看数据库中收录的突变频谱信息,包括两个部分
1. Mutational profiles
根据以下4种条件,分别计算突变频谱
Cancer types
Primary tumor sites
Benign samples
Cancer Census Genes
以肿瘤类型为例,结果示意如下
每个突变频谱用一个MG
开头的编号唯一标识,提供了对应的频率分布柱状图,示意如下