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mSignatureDB是一个肿瘤突变特征的数据库,以COSMIC数据库中收录的30种突变特征作为参照,分析了来自TCGA和ICGC中约15000多个肿瘤样本中这30种突变特征的构成,文章发表在Nucleic Acids Research上,链接接如下
https://academic.oup.com/nar/article/46/D1/D964/4626771
数据库的网址如下
http://tardis.cgu.edu.tw/msignaturedb/Browse/
通过Browse
菜单,可以查看肿瘤样本中30种突变特征的构成,分成了以下3个层次
project
primary site
country
sample
结果以气泡图的形式呈现, 鼠标点击可以看到每个特征的具体贡献率,示意如下
通过Search
按钮,可以查看以下信息
1. summary
给出了对应的突变频谱,结果示意如下