四、肿瘤全基因组学体细胞点突变特征(The repertoire of mutational signatures in human cancer)

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一、肿瘤突变特征:碱基置换及插入、缺失突变

单碱基置换(49种特征类型,single-base-substitution,SBS)
双碱基置换(11种特征类型,doublet-base-substitution,DBS)
多碱基置换(4种特征类型,clustered-base-substitution,CBS)
小的插入、缺失突变(17种特征类型,small insertion-and-deletion,small indels)

CNS-GBM SBS ≈ 10 mb;DBS ≈ 0.01 mb;Indels ≈ 0.3 mb
在这里插入图片描述

二、单碱基置换、双碱基置换及小的插入、缺失突变概况

单碱基置换(96种类型,49种特征类型,single-base-substitution,SBS)
双碱基置换(78种类型,11种特征类型,doublet-base-substitution,DBS)
多碱基置换(4种特征类型,clustered-base-substitution,CBS)
小的插入、缺失突变(83种类型,17种特征类型,small insertion-and-deletion,small indels)

SBS 有六种突变,考虑到突变所占比重不同,理论上有 C 6 1 C_{6}^{1} C

Matlab 储备指的是一个个人或团队在使用 Matlab 软件时所拥有的技能、经验、知识和工具。拥有丰富的 Matlab 储备意味着能够熟练地使用 Matlab 进行数据处理、算法开发、图形可视化、模拟仿真等各种科学计算任务。 Matlab 是一种强大的科学计算软件,它提供了丰富的数值分析和数据处理工具,能够帮助工程师、科研人员和学生解决各种实际问题。Matlab 储备通常包括以下方面: 1. Matlab 基础知识:掌握 Matlab 的基本语法、数据类型、变量操作、控制语句等基本概念和技能。 2. 数据处理与可视化:熟悉使用 Matlab 对数据进行读取、处理、分析和可视化的方法,如矩阵操作、统计分析、绘图、图像处理等。 3. 算法开发与优化:具备编写高效算法的能力,能够利用 Matlab 编写各种数值计算、优化和机器学习算法,并进行性能优化。 4. 模拟仿真与建模:能够使用 Matlab 进行复杂系统的建模与仿真,如电路仿真、控制系统设计、通信系统建模等。 5. 工具箱应用:熟悉并能够灵活使用 Matlab 的各种工具箱,如信号处理工具箱、图像处理工具箱、控制系统工具箱等,以及相关的函数和工具。 6. 代码编写与调试:具备良好的编程风格和代码质量意识,能够编写清晰、健壮的 Matlab 代码,并能够进行调试和错误处理。 拥有丰富的 Matlab 储备对于在科研、工程和教学等领域中的工作非常重要。技术熟练和经验丰富的 Matlab 用户能够更快速地解决问题,提高工作效率,并能够更好地理解和应用 Matlab 的各种功能和工具。因此,掌握和提升 Matlab 储备是每个使用 Matlab 的人需要不断努力的方向。
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