转移性乳腺癌的基因组图谱突出了突变和特征频率的变化
The genomic landscape of metastatic breast cancer highlights changes in mutation and signature frequencies
摘要部分
442个乳腺癌转移的病人样本的全基因组测序,表明,相比于原位乳腺癌,转移的乳腺癌病人基因组的肿瘤突变负荷TMB加倍。6个已知驱动突变基因的突变频率和突变特征的相对贡献也增加。还观察到与前治疗显著相关。突变信号17的贡献在用氟尿嘧啶、紫杉烷、铂和/或灯盏花素预处理的患者中显著增强,而在本研究中确定的新突变信号I与含铂化疗的预处理显著相关。临床相关的肿瘤亚组被确认,表现为同源重组缺陷(13%)、高肿瘤突变负担(11%)或与FDA批准药物敏感性相关的特异性改变(24%)。
原位乳腺癌是由将近100个基因的突变和乘客基因基因突变导致的异质性事件。主要包括年龄相关的退变和HRD(同源重组缺陷),以及载脂蛋B mRNA编辑酶催化多肽样突变(APOBEC)。
尽管原位乳腺癌每年的发生率很高,但是病人的死亡率却主要是和转移性乳腺癌有关。由于肿瘤的进化和治疗的压力,导致转移性的乳腺癌的基因组发生于原位乳腺癌肿瘤较大的改变。因此通过基因组特征分析,将会给转移性乳腺癌进行全面的分析,解析转移过程中的活跃分子事件。这对了解全身治疗对肿瘤基因组的影响以及最终改善转移性乳腺癌患者的治疗有至关重要的影响。
本项研究通过WES 测序,发现在转移乳腺癌中,存在大量与原位乳腺癌相同的基因突变,但是它们也展现出与原位肿瘤明显不同的基因类型