MINT:蛋白质相互作用数据库简介

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!
MINT, 全称molecular interaction Database, 是一个蛋白质相互作用的数据库,该数据库中的蛋白相互作用都是由专家审核过的有实验证据支持的,目前该数据库涵盖了607个物种,共117001个蛋白相互作用关系。网址如下

https://mint.bio.uniroma2.it/

目前该数据库中的数据已经集成到intact这个数据库中去了,所以官网上只提供了下载功能,示意如下
在这里插入图片描述
既可以一次下载整个数据库中的所有内容,也可以只下载常见物种的数据。下载的文件格式称之MITAB格式,这种格式是\t分隔的纯文本文件,专门用来描述两个蛋白间的相互作用。

对于蛋白A和蛋白B, 如果二者存在相互作用,就说存在一个interaction, 而蛋白A和B称之为interactors, 在MITAB格式的文件中,除了记录interaction 之外,还记录了interactors的诸多属性。该文件列数很多,下面对前15列信息进行说明

1. column1

第一列记录的信息为Unique identifier for interactor A, 代表蛋白A的唯一标识符,在MINT数据

  • 1
    点赞
  • 7
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值