HPRD:human专属的PPI数据库

最新推荐文章于 2023-07-21 10:41:45 发布
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分类专栏： 转录组 文章标签： HPRD PPI 蛋白质相互作用
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HPRD（Human Protein Reference Database）是一个专注于人类蛋白质相互作用的数据库，其数据经过实验验证且数量丰富。与其他数据库相比，HPRD在数据质量和数量上具有优势，提供蛋白质的多种注释信息，包括表达谱、分类、结构域等。用户可以检索蛋白质信息并下载数据，但商业使用可能有限制。HPRD是研究蛋白质网络和相互作用的强大资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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HPRD全称Human Protein Reference Database, 是一个专门存储人类蛋白质相互作用信息的数据库，和其他同类数据库相比，该数据库中存储的蛋白质互作信息都是经过实验验证的，而且数量上有明显优势。该数据的网址如下

http://hprd.org/index_html

在文献中，对HPRD和其他数据库进行了比较，结果如下
在这里插入图片描述
图片A表示不同数据库中存储的人类蛋白质相互作用的数据，从柱状图上可以明显看到，HPRD的数据量最大，而且冗余的信息很少；图片B表示不同数据库中蛋白相互作用数量的分布，从图中可以看到，每个阶段都是HPRD最佳。

除了数据质量和数量上的优势，HPRD还提供了蛋白质的表达谱，分类，结构域，亚细胞定位，转录后修饰，通路等其他信息，该数据库最新版为release 9, 其中的信息统计如下
扫
在这里插入图片描述
通过Query, 可以检索某个蛋白质的相关信息，示意如下

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