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HPRD全称Human Protein Reference Database, 是一个专门存储人类蛋白质相互作用信息的数据库,和其他同类数据库相比,该数据库中存储的蛋白质互作信息都是经过实验验证的,而且数量上有明显优势。该数据的网址如下
在文献中,对HPRD和其他数据库进行了比较,结果如下
图片A表示不同数据库中存储的人类蛋白质相互作用的数据,从柱状图上可以明显看到,HPRD的数据量最大,而且冗余的信息很少;图片B表示不同数据库中蛋白相互作用数量的分布,从图中可以看到,每个阶段都是HPRD最佳。
除了数据质量和数量上的优势,HPRD还提供了蛋白质的表达谱,分类,结构域,亚细胞定位,转录后修饰,通路等其他信息,该数据库最新版为release 9, 其中的信息统计如下
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通过Query
, 可以检索某个蛋白质的相关信息,示意如下