A3D Model Organism Database | http://biocomp.chem.uw.edu.pl/A3D2/MODB | 模式生物蛋白质组的聚集预测 |
ABC-HuMi | https://www.ccb.uni-saarland.de/abc_humi/ | 人类微生物群体中的生物合成基因簇 |
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DRMref | https://ccsm.uth.edu/DRMref/ | 基于单细胞数据的癌症药物抗性机制 |
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SCAN | http://scanatlas.net | 神经细胞时空云图集 |
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UTexas Aptamer Database | https://sites.utexas.edu/aptamerdatabase/ | 适配体数据库 |
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ZEBRA | https://www.ccb.uni-saarland.de/brain_atlas | 脑单细胞基因表达图谱 |