虚拟筛选在药物发现中的意义

文章概要
近二十多年来，分子对接代表的基于结构的虚拟筛选已成为基于结构药物设计的标准方法。然而，随着对这些方法的局限性、潜力和优势的日益了解，人们对虚拟筛选也有了更高的期望。
作者研究了2014-2018年近五年发表的虚拟筛选文章，试图从以下几个方面对虚拟筛选进行评价：1、预测的结合模式是否与蛋白晶体数据一致；2、是否如文献中常常形容的那样是一种优良筛选工具；3、是否能成功筛选到新颖的化学骨架，用于先导化合物优化循环的初始结构。数据显示，在药物研发早期工作中，对靶标的正确理解以及对化合物的后处理才能真正发现可靠的活性化合物。
在大多数情况下，虚拟筛选能准确的把化合物放置在蛋白口袋，但无法对预测结果进行准确评分。但重要的是虚拟筛选让我们利用现有资源更容易得到先导化合物或者优势系列。多种方法的融合，如根据受体配体特点进行人工选择、实验导向的化合物库，经过验证优化找到最优的分子对接和打分方法，约束受体配体相互作用、精心设计的筛选策略及预先定义的打分标准，加强了虚拟筛选在药物研究中的地位。

虚拟筛选文章统计
图片来源Expert Opinion on Drug Discovery
二十多年来，分子对接和虚拟筛选一直是基于结构药物设计的标准方法。计算速度、大分子结构和蛋白质序列数据是推动虚拟筛选发展的最重要的三个因素。尤其是高通量晶体学和核磁共振技术能在高精度下解析了蛋白-配体复合物结构，并且还在解析更多大分子结