在Windows的Subsystem Linux（WSL）下安装gromacs

在Windows的Subsystem Linux（WSL）下安装gromacs

参照[官网安装指导](Installation guide — GROMACS 2021.1 documentation)做的，记得根据自己的版本换不同的guide
系统基于Windows 10 Pro版，低版本可能不支持WSL

Subsystem安装

参考安装sublinux
根据上述链接配置并下载就可以了

做到第三步就可以了
后面直接开始菜单里打开Ubuntu就行

打开

​ 搜索Ubuntu，选个你喜欢的版本下载。（我直接下的现在有的最新版 ，20.04 LTS)

​ 下载好后配置方式很简单，不懂的百度即可

安装编译环境

先更新

sudo apt-get update

装cmake

sudo apt-get install cmake

装编译环境(我的是自带了gcc)

sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install g++

装gromacs

如果你是Ubuntu的话，直接

sudo apt install gromacs

就行。

下面是官网的安装方式：

打开[gromacs官网下载](Welcome to the GROMACS documentation! — GROMACS documentation)到下载界面，找到下载地址，下载。

下载

wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.1.tar.gz

下面直接复制了教程的

tar xfz gromacs-2021.1.tar.gz
cd gromacs-2021.1
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
make
make check
sudo make install
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC

这里建议上一个最后一步如果报错的话按照路径翻一下GMXRC文件夹在哪里，找到了就可以

简单的Linux文件夹操作方式 参考一下 菜鸟教程

最后一句话我的跟原教程不太一样

source /usr/local/bin/GMXRC

盲猜安装的时候出了点小问题

但无所谓了 可以用

安装结果测试

安装完输入

gmx -version

能看到版本信息说明安装成功了。

一点不知道有没有用的Tips

最后 建议在 /mnt目录下的磁盘中找个位置做仿真等内容，这个目录里面的磁盘相当于当前Windows系统磁盘的一个映射，比较方便两个系统的文件传输。
（包括虚拟机用户和subsystem用户）
如果服务器的话，一般自己的主目录就在 /home里
下面简单介绍了几个Linux命令，可以参考一下
具体linux详细命令请参考菜鸟教程

命令	作用	示例
ls	列出当前目录的文件和文件夹	无
cd	跳转到目录	cd+目录名
mkdir	创建目录	mkdir+创建的目录名
wget	从网上下载东西	wget+下载链接/wget+ -o + 保存为的名字 + 下载链接