空间转录组分析实战0：前言

空间转录组技术被Nature Methods 评为 2020 “年度技术”（封面）

空间多组学（Spatial multi-omics）技术上榜2022年Nature年度关注七大榜单技术

空间组学（Spatial omics）入选《2023年十大新兴技术报告》

Bulk RNA-seq、scRNA-seq 与 空间转录组(ST) 示意图

技术原理： 10x Genomics Visium

10x Visium空间转录组测序基于PolyA尾捕获的原理进行，依托于基因表达芯片和组织透化芯片，每个基因表达芯片包含四个捕获区域，大小为6.5mm x 6.5mm，5000个spots，spots大小为55μm，数百万条引物（引物结构：poly（dT）+UMI+Barcode）。

10x Visium 工作流程

1. 样本制备：支持FFPE 与 Frozen

2. 染色与成像：H&E  或  IF（免疫荧光）

3. 组织透化及文库构建：上机测序

4. 数据分析可视化：R语言或 Loupe Browser

本期简要介绍10x Genomics Visium 空间转录组技术原理，实际上关于空间转录组学的介绍已经是铺天盖地了，这里就不过多介绍了；下期将带来空间转录组学入门分析实战！