MSA多序列比对（multiple sequence alignment）

已于 2023-04-12 17:48:33 修改
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分类专栏： 蛋白质相关知识 文章标签： 学习
于 2023-04-12 17:47:50 首次发布
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MSA多序列比对用于比较多个生物序列，寻找相同残基并定位功能区域。此技术有助于识别物种间的相似性，建立系统发生树，以及预测蛋白质功能和结构。通过比对，可以推断未知序列的功能，并预测二级结构。

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MSA多序列比对（multiple sequence alignment）

把两个以上序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列的字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征

文章中作者通过多序列比对找出与人蛋白质相似的来自其他物种的蛋白质序列

MSA的作用

使得参与比对的序列有尽可能多的列具有相同的字符，使得相同残基的位点位于同一列，以便发现不同序列之间的相似部分，从而推测他们结构和功能上面的相似关系

  1. 确认：一个未知的序列是否属于某个家族
  2. 建立：系统发生树，查看物种间或者序列间的关系
  3. 模式识别：一些特别保守的序列片段往往对应重要的功能区域，通过多序列比对，可以找到这些保守的片段
  4. 已知推断未知：把已知有特殊功能的序列片段通过多序列比对做成模型，然后根据该模型推断未知的序列片段是否具有该功能
  5. 其他：预测蛋白质/RNA二级结构
    :::success
    多序列比对网站：www.ebi.ac.uk/Tools/msa/
    tcoffee.crg.
    :::
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多序列比对（MSA）
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多序列比对（Multiple Sequence Alignment, MSA）是生物信息学领域中用于分析和比较多个生物序列之间相似性关系的重要方法。其目的是通过将多个序列对齐，逐列比较其字符的异同，以揭示序列间的共同结构特征。MSA是双序列比对的扩展，用于建立基因家族中成组序列之间的关系，以阐明生物学模式。MSA的基本概念包括将多个序列对齐，使得等同位点在同一列上，并通过插入小横线（“-”）使序列长度一致。
snapgene怎么比对序列_多重序列比对(MSA)分析工具怎么选，看这一篇就够了
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【代码】Msa类处理多序列比对数据。
多序列比对
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文章转载于Original2017-07-11liuhui 生信百科 多序列比对（或多序列联配，multiple sequence alignment，MSA），是指把多条（3 条或以上）有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对，尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一列上。这样做的意义是，对齐的碱基或氨基酸残基在进化上是同源的，即来自共同祖先（common ancest...
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生物信息之多序列比对，进化树分析，保守位点分析
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