【病理数据】svs格式数据解读

Openslide

病理图像通常以.svs格式存储在数据库中。要想使用python处理svs格式的图像,我们通常使用Openslide模块。
关于Openslide模块的安装详见这个博客:
【解决Error】ModuleNotFoundError: No module named ‘openslide‘

病理图像数据结构

病理图像svs数据是以金字塔结构存储的。
为什么病理图像会有这么多level?
不同的level对应不同的放大倍数
病理学家在用仪器对切片进行图像采集时,涉及到不同的放大倍数。不同的放大倍数展示了不同程度的细胞信息,例如放大倍数越小,看到的更多是全局的图像轮廓信息,放大倍数越大,看到的更多是局部的细胞分化等信息。这些不同的信息对于之后的肿瘤预测的不同任务有不同的作用。因此,svs格式保留了不同放大倍数下的图像信息。

在这里插入图片描述

可以使用以下代码查看WSI图像的level信息:


                
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值