最近在接触遗传进化,进化树必不可少,我记得之前Y叔在公众号推过他的ggtreeExtra包,所以我直接去公众号搜了一下,发现应用ggtreeExtra在ggtree基础上绘制的图挺好看,果断开始接触练习。一开始安装的时候就出问题了,我电脑上的R是3.6.1和3.6.3,貌似版本过低。
BiocManager::install("ggtreeExtra")
所以我用自己服务器上不怎么用的4.1.1版的R下载了一下,果然是版本过低,4.1.1的R直接就下载下来了。
然后果断练习
数据都是自己瞎编的,反反复复就那一个,懒得整分组,导致图例啥都是一样的,了解如何绘图就好!
参考:
https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra
https://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/ggtreeExtra/inst/doc/ggtreeExtra.html