解决数据上传NCBI时的“multiple BioSamples cannot have identical attributes”错误!

解决数据上传NCBI时的“multiple BioSamples cannot have identical attributes”错误!

ERROR:

Your table upload failed because multiple BioSamples cannot have identical attributes. You should have one BioSample for each specimen, and each of your BioSamples must have differentiating information (excluding sample name, title, bioproject accession and description). This check was implemented to encourage submitters to include distinguishing information in their samples. If the distinguishing information is in the sample name, title or description, please recode it into an appropriate attribute, either one of the predefined attributes or a custom attribute you define. If it is necessary to represent true biological replicates as separate BioSamples, you might add an ‘aliquot’ or ‘replicate’ attribute, e.g., ‘replicate = biological replicate 1’, as appropriate. Note that multiple assay types, e.g., RNA-seq and ChIP-seq data may reference the same BioSample if appropriate.

上传16s/RNAseq/chip_seq时遇到这个问题怎么办?

搜了一晚上,发现基本没人说到重点!

  • 关键问题:

    表格中的绿色必填项,一定要保证至少一个因子可以区分各个样本(名字除外)。也就是说,除了样本名之外,剩下的必填项中必须还有一个项目是在每个样本都不同的。

  • 解决办法:

    如果大家和我一样,除了样本名其他不是一样就是没信息,那么我推荐大家直接修改*lat_lon,也就是经纬度。由于经纬度是保留到小数点后两位,我们直接一次加0.01(在EXCEL往下拉快速填充即可!),对于位置几乎没影响,也可以区分样本,完美解决。

    还有问题的话可以关注我的w x公 号【木舟笔记】,直接后台私信。

  • 6
    点赞
  • 3
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 3
    评论
转录组数据是指对生物体中的转录本进行测序获得的RNA序列数据。将转录组数据上传NCBI(National Center for Biotechnology Information)是为了共享和存档这些数据,以便研究人员可以进行后续的分析和比较。 首先,我们需要准备好转录组数据的文件,通常是以FASTQ格式存储的序列数据文件。接下来,我们需要访问NCBI的网站,进入Gene Expression Omnibus(GEO)数据库。在GEO数据库中,我们需要创建一个新的实验以上传我们的数据上传数据的第一步是填写实验信息。这包括实验的名称、描述、样本信息等。我们需要提供足够的详细信息,以便其他研究人员可以了解实验的目的和样本来源。 接下来,我们需要上传转录组数据文件。在GEO数据库的网站界面上,有一个可以选择文件上传的选项。我们可以选择转录组数据文件所在的位置,并进行上传上传完成后,GEO数据库会对文件进行验证,确保数据的准确性和完整性。 最后,我们需要确认上传的转录组数据的相关信息,并提交验证。在提交之前,我们可以预览上传数据,检查是否正确并符合预期。一旦确认无误,我们可以点击提交按钮,将转录组数据上传NCBI的GEO数据库中。 上传完成后,我们会收到一个与我们的数据关联的唯一标识符,可以用于引用和查找我们的数据。其他研究人员可以通过该标识符访问和下载我们上传的转录组数据,从而进行后续的研究和分析。 总之,将转录组数据上传NCBI需要准备好数据文件,填写实验信息,上传数据文件,确认并提交上传。这样,我们的转录组数据就可以在NCBI数据库中共享和存档,促进科学研究的进展。

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 3
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值