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为什么公共数据库能火起来?我个人的观点是,样本量大、代表性强,发表的文章质量高。因此,越来越多来不及做实验的临床医生开始转战公共数据库。
其中,MIMIC数据库作为重症医学领域的一名大将,为普通医生,特别是重症医学科医生开展临床研究提供了极大的便利。先前我们已经详细介绍过该数据库,点击链接可了解详情:
你的强来了!MIMIC数据库还能发4万多篇SCI文章,再不挖掘就晚了!
当前重症医学领域开放的免费数据库,除了提到的MIMIC系列外,还有eICU、PIC、AmsterdamUMCdb和HiRID等。今天就给大家详细介绍下这四个数据库!
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eICU数据库
eICU数据库(eICU Collaborative Research Database)是一个多中心的重症监护病房数据库,涵盖了2014年和2015年,美国208家医院139,367名患者的200,859份重症监护病房就诊数据。
具体包括生命体征测量、护理计划文档、疾病严重程度测量、诊断信息、治疗信息等多个维度的重症医学数据信息。
网址:https://eicu-crd.mit.edu/
在今天介绍的数据库中,eICU数据库的发文量最多(253篇),并且它还支持临床研究、预测模型开发等多类型的研究。
不过,该数据库数据虽然是免费的,但获取流程较复杂,需要先取得麻省理工大学附属数据相关课程的合格证书,之后在PhysioNet上注册账号,提交证书并进行资格认证申请,在审核通过后方可进行下载。
文章推荐:
学者联合MIMIC数据库和eICU数据库的数据,构建了机器学习预测模型,发文一区top(IF=27.1)。
机器学习衍生的败血症治疗方案
2
儿童重症监护数据库
儿童重症监护(PIC)数据库是对MIMIC数据库的补充,它是一个针对儿科的大型单中心双语数据库,包含了2010~2019年,在浙江大学医学院附属儿科医院重症监护病房住院的一万多名儿科患者的相关信息。
具体包括人口统计、手术期间的生命体征测量、实验室检查结果、症状、药物和死亡率等信息。
网址:http://pic.nbscn.org/
该数据库发文仅23篇,发文竞争力很小!并且,只需注册并简单填写申请表即可免费获取数据。对于想要探究儿科重症监护领域的朋友,是一个非常值得推荐的数据库。
文章推荐:
中国学者基于儿童重症监护数据库的数据,探究TyG指数与危重儿科患者死亡风险的关联,发文一区top(IF=8.5)。
危重儿科患者甘油三酯-葡萄糖指数与全因死亡率之间的U型关联:一项基于人群的回顾性队列研究
3
AmsterdamUMCdb数据库
阿姆斯特丹大学医学中心数据库(AmsterdamUMCdb)是欧洲第一个免费访问的重症监护数据库,包含了数万名欧洲重症监护病房入院患者的健康数据。具体包括人口统计学,生命体征,实验室检查和药物治疗等。
网址:https://amsterdammedicaldatascience.nl//amsterdamumcdb/
该数据库数据庞大,目前的发文量为31篇!但该数据库的数据获取与eICU数据库一致,需先完成必修的培训课程,再提交申请才能免费获取数据。
文献推荐:
学者联合MIMIC数据库和AmsterdamUMCdb数据库,测量低氧性呼吸衰竭患者在达到生理阈值后3小时内进行有创通气的概率,发文一区top(IF=19.3)。
低氧性呼吸衰竭有创通气的阈值存在吗?一项队列研究
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HiRID数据库
HiRID作为一个免费访问的重症监护数据集,涵盖了2008年1月至2016年6月期间,瑞士伯尔尼大学医院(ICU)重症医学系的3.3万多名入院患者的数据。
具体包括人口统计数据、床边监测的测量结果、医疗设备(如机械通气)的测量和设置、卫生保健提供者的观察情况、实验室数据以及服用药物、液体和营养等。
网址:https://hirid.intensivecare.ai/
相较于其他已经发表的数据集,HiRID具有更高的时间分辨率,每两分钟就能存储一个条目。并且,该数据库是这四个数据库中发文量最少的一个,仅6篇,含金量不言而喻!不过,想要获得数据,研究者必须是经过认证的PhysioNet用户。
文章推荐:
学者使用HiRID数据库的数据,测试之前基于11位ICU专家独立标注的数据集训练出来的11个分类器的性能,发文一区top(IF=12.4)。
不一致的人类注释对人工智能驱动的临床决策的影响
综上所述,这四个重症医学数据库各具特色且数据均可免费获取,为研究者提供了丰富的数据资源。此外,相较于MIMIC数据库,这些数据库的发文量相对较少,具有很大的发文潜力。
没有临床数据的小伙伴可以多了解下这些免费的数据库,根据自己的研究需求和兴趣选择合适的数据库进行深入研究。
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