linux版本下的超简单的生信分析平台介绍

为了满足大家个性化的需求，六点了​​​​​​​开发出了Sixbox-linux ，也就是sixbox的linux版本，来实现本地linux机器、集群等linux服务器的快速部署和使用。

Sixbox-linux现在已经开放使用，欢迎大家到官网安装使用！同时有更好的使用体验，这里为大家详细展示从安装、配置到使用的所有要点。

本文导读

安装：下载、 配置文件、 CWLdb （workflow仓库）

使用：读写配置文件、运行CWL、从仓库中获取CWL流程、查看CWL流程、提交CWL流程到仓库、修改tag、删除仓库中的workflow

版本更新及其他

Sixbox-linux 安装

■ 下载

1.前往官网下载中心下载安装脚本Sixbox_linux64_latest.sh在linux终端运行以下指令

bash Sixbox_linux64_latest.sh

2.按照安装程序屏幕上的提示进行操作（如果您不确定任何设置，可以接受默认值）。

3.为了使更改生效，请关闭然后重新打开终端窗口。

4.请测试您的安装。在终端窗口，运行sixbox -h命令。如果已正确安装，将显示参数说明。

至此，Sixbox-linux的安装和配置顺利结束。

■ 配置文件

在了解Sixbox详细用法之前，您需要知道Sixbox配置文件的相关信息。

Sixbox的配置文件用于Sixbox权限控制、记录sixoclock软件仓库地址源和CWLdb路径，您可以在${HOME}/.sixbox/config.yaml中查看。

一个Sixbox配置文件的示例：

libPath: /root/.sixbox/lib
channel: https://www.sixoclock.net/api
token: eyJ0eXAiOiJKV1QiLCJhbGciOiJIUzI1NiJ9.eyJleHAiOjE2MzU2NzA0MjYsImlhdCI6MTYzNTY2NjgyNiwidWlkIjoiMTBhOGQ2YzUtZWM4MC00Mzg5LThlYTMtZWYyYTgyY2JlN2M5IiwiaXNfcmVmcmVzaCI6ZmFsc2UsInVuYW1lIjoiNjY2b2Nsb2NrIiwicGVybWlzc2lvbnMiOjIzfQ.ru86vr9cB2hlH-Sgf0i93A9D3_rEX2pk8Zvc1GHaZ

Sixbox配置文件中记载了三类信息：

1. token：记录您在sixoclock获取的授权token。

2. channel：记录sixbox从sixoclock仓库中拉取CWL Workflow的地址。

3. libPath：记录了CWLdb的lib路径，Sixbox默认lib路径在您安装Sixbox-linux的根路径。您也可以通过config中相关命令自定义该路径。

■ CWLdb（workflow仓库）

当您在使用Sixbox时，它会为您在本地自动建立一个名为CWLdb的CWL Workflow仓库，以便您管理、运行