生信分析--入门实践一条龙的CWL中文教程

1

WHY 

刚开始学习处理生物医疗健康数据的时候，作为初学者的你可能跟我一样需要经历了很长一段在电脑前疯狂挠头的日子，翻论坛、翻博客、找经验贴试图在庞大的互联网上查找自己搞不懂的问题。

捉到一个相关文档，瞬间如获至宝。

然而，参照的时候你可能会被各种不知名bug提示搞得再次焦头烂额。而且东一榔头西一棒子，很难找到成体系，完整集成的软件流程。

因为不同的文章或者不同领域采用的是软件、配置、流程组合可能都有差别。

每每学习其他人分析流程中的软件以及软件下载时候需要的参数配置，以及跑流程中出现各种不兼容报错让人无限的崩溃再崩溃。经验贴以及科研文章中的内容很难完美的运行下来。问题→学习→更多问题... 本来的一个问题可能伴随着无数新的问题出现。

当你已经开始入门的时候，你也许也会遇到另外的问题：部门或科室的一个项目中分批量的多次实验分析或者甚至是多个项目中的类似处理，你可能需要手动一个个进行处理，而这个时候如果你有一个准备好的“SOP”，一个标准工作流程，那是立马起飞，火速下班或者不再数次的一步步机械无脑烦躁的流水线工作啦。 

2

WHAT