STAR构建index报错src/Genome_genomeGenerate.cpp:219:genomeGenerate: exiting because of *OUTPUT FILE* erro

于 2023-03-02 12:59:16 发布
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分类专栏： 报错 文章标签： linux
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用star构建index时出现如下报错：

src/Genome_genomeGenerate.cpp:219:genomeGenerate: exiting because of *OUTPUT FILE* error: could not create output file reference/mouse/STARindex/chrName.txt
SOLUTION: check that the path exists and you have write permission for this file. Also check ulimit -n and increase it to allow more open files.

原因，输出文件夹STARindex需要自己手动建立

建立好之后再重新跑即可

参考about the genomeGenerate error · Issue #676 · alexdobin/STAR (github.com)

小羊小羊，遇事不难
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