orthovenn2

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文章标签： ubuntu windows linux 服务器
于 2023-04-01 15:44:48 首次发布
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比较基因组学利器之OrthoVenn2-转载 - 简书

必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2 - 组学大讲堂问答社区

利用OrthoVenn2进行多物种全基因组直系同源基因簇比较和注释 – sci666

Orthovenn2，搭建属于你的比较基因组学利器 - 简书

全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系。

OrthoVenn2是由西南大学生物学研究中心王翊教授开发一款用于多物种全基因组直系同源基因簇比较和注释的在线工具，可对多物种全基因组直系同源基因簇比较和注释。

OrthoVenn2基于OrthoMCL启发式匹配算法，用DIAMOND进行比对，比传统的BLAST算法速度提高了1万倍，OrthoVenn2基因组蛋白序列来源于Ensembl数据库，通用性更强，单次在线分析的上限物种数量提高了1倍达12个。

OrthoVenn2还提供了本地版本下载，可以处理更大数据量的分析，无物种数限制，分析环境封装于docker镜像中，个人安装docker后直接下载OrthoVenn2镜像即可使用，还未安装docker或者不了解docker的朋友请点击链接学习：生信学习第一步！免费领取一套docker虚拟机！

在线工具 OrthoVenn2  

 OrthoVenn2

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