Galaxy是一个在线的生物信息云平台,目前已经上线了1300+生信实用工具,整合的一键式分析流程也在陆续上线中。这些工具/流程涵盖生物信息数据分析的方方面面,包括但不限于:
基因组数据分析
转录组数据分析(Bulk RNA-seq, Single Cell RNA-seq)
蛋白质组数据分析
癌症基因组测序研究
统计学 / 机器学习
生信绘图
Galaxy能够进行生物信息学上下游全链条的数据分析,它可以服务于:
学生,学习生物信息学;
教师,讲授生物信息学;
科研人员,快速进行数据分析,无需繁琐的工具安装和流程搭建,把精力放到生物学意义的挖掘上。
如何开始使用Galaxy?本文将介绍Galaxy中的关键任务:上传文件、使用工具、查看历史记录以及运行工作流程。
Galaxy的外观
打开任意浏览器(推荐Chrome)
输入网址:usegalaxy.cn
注册 & 登录
Galaxy主页分为四个面板,从左到右为:
活动栏
工具面板
视图面板
历史面板
首次使用Galaxy时,历史面板中不会有文件。
关键操作
命名历史面板
来到右侧的历史面板
点击(Edit)
输入一个新的名称,如:Learn To Use Galaxy
点击保存
如果无法重命名,可能你没有登录,请登录后重试。
上传文件
工具位于左侧的面板中。
在工具面板的上方,点击Upload Data
这将打开一个界面。
点击 粘贴数据或链接
粘贴一个文件地址:
https://zen