Horticulture Research 模式图的手稿

最新推荐文章于 2025-05-09 16:30:00 发布

刘永鑫Adam

最新推荐文章于 2025-05-09 16:30:00 发布

阅读量1.3k

点赞数

文章标签：编程语言人工智能大数据数据可视化 xhtml

原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/5jQspEvH5_4Xmart22gjMA#rd

版权

这篇文章开始于2017年，当时这个是袁军老师安排的属于一个附属的小实验，测过来看看不同抗病性能的植物根际微生物群落是否存在变化，或者根际微生物群落是否在植物抗病中起着某种作用，在17年底我们整理结果的时候，发现显然是有的。没想到上半年就有了一篇ISME J发文大豆抗病感病品种的微生物群落差异，虽然规律不同于这篇文章，但我们后续的工作还是就想及时收住，放了一年多时间，等到后面19年的时候终于有时间继续这个工作。补充上了纯培养的部分，直接投到了Horticulture Research（IF= 5.4）。

为什么我要写这么一段话呢？因为当时这篇文章是我分析体系形成的第一篇文章，也是我写的第一篇文章，里面包含了我自己思索的扩增子代谢组整合套路。所以对于初学者来说，希望带给大家学习扩增子代谢组套路。说实话Horticulture Research编委会非常负责人，最后proof之后再给我们语言和细节进行了前所未有的最细致的修正，有机会将这篇proof分享给大家。实在是受益良多。欢迎大家关注微生信生物，关注我们的工作。

这篇文章的模式图，主要由一下几个部分组成，这里我提供其模式图出图的全部过程，供大家学习。学了就会了，没学会直接也可以修改素材，原图PPT在公众号回复“hr”获取

公众号内回复："HR"即可获取模式图

系列教程：微生物组入门 Biostar 微生物组宏基因组

专业技能：学术图表高分文章生信宝典不可或缺的人

一文读懂：宏基因组寄生虫益处进化树

必备技能：提问搜索 Endnote

文献阅读热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析：图表解读分析流程统计绘图

16S功能预测 PICRUSt FAPROTAX Bugbase Tax4Fun

在线工具：16S预测培养基生信绘图

科研经验：云笔记云协作公众号

编程模板: Shell R Perl

生物科普: 肠道细菌人体上的生命生命大跃进细胞暗战人体奥秘

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难，我们建立了“宏基因组”专业讨论群，目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论，获得专业解答，欢迎分享此文至朋友圈，并扫码加主编好友带你入群，务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份，另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助，首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路，仍未解决群内讨论，问题不私聊，帮助同行。