《热心肠日报》2022-23年全球肠道菌群研究十大人物

在过去的一年多时间里，全球肠道领域研究继续高歌猛进，取得了颇多令人瞩目的进展。

2023肠道大会来临之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2022年5月以来一年期间（2022年5月1日至2023年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2022-2023年度榜单。

2022-2023年度榜单参评的文章共有3388篇，发表在420个不同的期刊上，累计影响因子达到了82902.36，平均影响因子24.48。其中来自Cell、Nature、Science的文章133篇，来自NEJM、Lancet、JAMA的文章54篇。

本榜单仅代表热心肠生物技术研究院基于自身数据所做的评选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。

本篇发布“全球肠道菌群研究十大人物”。

Ramnik Xavier

美国哈佛医学院麻省总医院 

美国哈佛-麻省理工博德研究所

Ramnik Xavier教授在美国哈佛大学医学院、麻省总医院和哈佛-麻省理工博德研究所（Broad Institute）等机构均担任重要研究职务。他和团队主要研究先天免疫和适应性免疫中重要的介质和效应因子的功能，近年来在炎症性肠病及婴幼儿的肠道菌群特征，以及宿主-菌群互作发病机制方面，取得了不少突破性成果。Xavier教授在科研方面持续高水平、高产出，过去一年中他作为通讯作者在Nature和Cell发表4项研究，是近年来全球肠道菌群研究十大人物的榜上常客。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Akkermansia muciniphila phospholipid induces homeostatic immune responses

Nature. 2022 Aug;608(7921):168-173. 

doi: 10.1038/s41586-022-04985-7.

【日报解读】Nature：Akk菌如何调节免疫？锁定新的关键分子

Identification of trypsin-degrading commensals in the large intestine

Nature. 2022 Sep;609(7927):582-589

doi: 10.1038/s41586-022-05181-3.

【日报解读】Nature：降解胰蛋白酶的肠菌，为肠道健康保驾护航

A distinct clade of Bifidobacterium longum in the gut of Bangladeshi children thrives during weaning

Cell. 2022 Nov 10;185(23):4280-4297.e12.

doi: 10.1016/j.cell.2022.10.011.

【日报解读】Cell：一个独特的长双歧杆菌分支，在孟加拉儿童断奶期间或有关键作用

Mobile genetic elements from the maternal microbiome shape infant gut microbial assembly and metabolism

Cell. 2022 Dec 22;185(26):4921-4936.e15.

doi: 10.1016/j.cell.2022.11.023.

【日报解读】Cell：母亲菌群塑造孩子肠道菌群的新机制

The CD4+ T cell response to a commensal-derived epitope transitions from a tolerant to an inflammatory state in Crohn’s disease

Immunity. 2022 Oct 11;55(10):1909-1923.e6.

doi: 10.1016/j.immuni.2022.08.016.

【日报解读】Cell子刊：克罗恩病患者的CD4+ T细胞对共生菌群的免疫耐受失调

Eran Elinav

以色列魏茨曼科学研究所

德国癌症研究中心

Eran Elinav教授目前在以色列魏茨曼科学研究所和德国癌症研究中心任职，也是全球肠道菌群研究十大人物的榜上常客，相信关注本领域研究的人对他都不陌生。他和团队致力于破解宿主-微生物组相互作用的分子基础，以及它们对健康和疾病的影响，以最终实现精准医学和个体化营养。过去一年中他作为通讯作者在Cell发表了2项研究，分别关注IBD的噬菌体疗法和人工甜味剂如何通过肠菌对人体的糖耐受施加个体化影响。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Targeted suppression of human IBD-associated gut microbiota commensals by phage consortia for treatment of intestinal inflammation

Cell. 2022 Aug 4;185(16):2879-2898.e24.

doi: 10.1016/j.cell.2022.07.003.

【日报解读】Cell：用噬菌体组合治疗肠道炎症

Personalized microbiome-driven effects of non-nutritive sweeteners on human glucose tolerance

Cell. 2022 Sep 1;185(18):3307-3328.e19.

doi: 10.1016/j.cell.2022.07.016.

【日报解读】Cell：零卡甜味剂可改变肠道菌群，对血糖造成个体化影响

A non-antibiotic-disrupted gut microbiome is associated with clinical responses to CD19-CAR-T cell cancer immunotherapy

Nat Med. 2023 Apr;29(4):906-916.

doi: 10.1038/s41591-023-02234-6.

【日报解读】Nature子刊：揭开肠道菌群与CAR-T免疫治疗效果间的神秘关系

David Artis

美国康奈尔大学威尔康奈尔医学院

David Artis教授是美国康奈尔大学的微生物学和免疫学教授，同时担任吉尔·罗伯茨炎症性肠病研究所所长。过去一年中，他和团队在Nature和Cell发表了2项有关肠道菌群的重磅研究。他课题组致力于解析屏障表面免疫细胞功能的调控途径，通过微生物定植、病原体感染和慢性炎症等不同模型，研究哺乳动物宿主的遗传学和来自共生菌群的信号如何影响皮肤、肺和肠道的先天和适应性免疫反应。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Inulin fibre promotes microbiota-derived bile acids and type 2 inflammation

Nature. 2022 Nov;611(7936):578-584.

doi: 10.1038/s41586-022-05380-y.

【日报解读】郭春君等Nature：菊粉如何通过菌群促进2型炎症？

Gut-innervating nociceptors regulate the intestinal microbiota to promote tissue protection

Cell. 2022 Oct 27;185(22):4170-4189.e20.

doi: 10.1016/j.cell.2022.09.008.

【日报解读】张雯等Cell突破：感受疼痛的神经如何调菌群、护肠道

Michael Fischbach

美国斯坦福大学

Michael Fischbach教授团队致力于解析宿主-菌群的相互作用，主要专注于两个研究领域：技术发展（涉及合成生物学、细菌遗传学工具、算法和计算工具等）以及分子机制（包括菌群小分子、复杂群落的生态学等）。他和团队在过去一年中在Cell和Science分别发表重要研究成果，探索了合成复杂肠道微生物群落和工程菌用于癌症治疗。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Design, construction, and in vivo augmentation of a complex gut microbiome

Cell. 2022 Sep 15;185(19):3617-3636.e19.

doi: 10.1016/j.cell.2022.08.003.

【日报解读】Cell：复杂且明确的合成人类肠道菌群模型

Engineered skin bacteria induce antitumor T cell responses against melanoma

Science. 2023 Apr 14;380(6641):203-210.

doi: 10.1126/science.abp9563.

【日报解读】Science：巧妙改造皮肤菌，激活免疫助抗癌

gutSMASH predicts specialized primary metabolic pathways from the human gut microbiota

Nat Biotechnol. 2023 Feb 13.

doi: 10.1038/s41587-023-01675-1.

【日报解读】Nature子刊：gutSMASH助力评估肠道菌群特定代谢潜力

Noah Palm

美国耶鲁大学医学院

Noah Palm教授团队专注于阐明免疫系统和肠道菌群在健康和疾病中的各种相互作用，特别强调开发新技术，以解开复杂的宿主-菌群通讯网络，并揭示菌群在人类健康和疾病中的因果作用。过去一年中，他们在Nature和Science分别发表重要研究成果，揭示了肠道致病共生菌如何在宿主内演化出转移到其他组织器官的能力，并探索了表达新型基因毒素的促肠癌细菌。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Within-host evolution of a gut pathobiont facilitates liver translocation

Nature. 2022 Jul;607(7919):563-570.

doi: 10.1038/s41586-022-04949-x.

【日报解读】Nature：肠菌可在宿主内演化出致病的移位能力

Commensal microbiota from patients with inflammatory bowel disease produce genotoxic metabolites

Science. 2022 Oct 28;378(6618):eabm3233.

doi: 10.1126/science.abm3233.

【日报解读】曹议匀等Science突破：锁定表达新型基因毒素的促肠癌细菌

Interspecies commensal interactions have nonlinear impacts on host immunity

Cell Host Microbe. 2022 Jul 13;30(7):988-1002.e6.

doi: 10.1016/j.chom.2022.05.004.

【日报解读】Cell子刊：共生菌的种间互作对宿主免疫具有非线性影响

Curtis Huttenhower

美国哈佛大学公共卫生学院

Curtis Huttenhower教授课题组的研究重心是微生物群落功能和人类健康交汇处的计算生物学，他和团队致力于研究各种计算方法，用于微生物群落、模式生物、病原体和人类基因组的数据挖掘。目前他们涉及的研究领域包括：微生物组流行病学的统计学方法、人类微生物组流行病学、炎症性疾病中的肠道菌群、解析微生物群落分子功能的计算方法等。他们团队深度参与了HMP2的炎症性肠病肠道菌群研究项目，并在过去一年中发表了2项重磅成果。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

Discovery of bioactive microbial gene products in inflammatory bowel disease

Nature. 2022 Jun;606(7915):754-760.

doi: 10.1038/s41586-022-04648-7.

【日报解读】Nature：用新方法系统性挖掘IBD相关的菌群蛋白

Gut microbial metabolism of 5-ASA diminishes its clinical efficacy in inflammatory bowel disease

Nat Med. 2023 Mar;29(3):700-709.

doi: 10.1038/s41591-023-02217-7.

【日报解读】Nature子刊：肠道菌群代谢5-ASA，降低其对炎症性肠病的疗效

Microbiome epidemiology and association studies in human health

Nat Rev Genet. 2023 Feb;24(2):109-124.

doi: 10.1038/s41576-022-00529-x.

【日报解读】Nature Reviews：一文+一图读懂人类微生物组流行病学研究

Robert Jenq

美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心

Robert Jenq教授团队主要从事骨髓移植方面的基础和临床转化研究，以期通过调节免疫系统和肠道菌群的干预策略来改善骨髓移植结果。他和团队还在菌群相关的癌症机制和治疗方面开展研究。

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2022年5月以来代表性论文（部分）

Mucus-degrading Bacteroides link carbapenems to aggravated graft-versus-host disease

Cell. 2022 Sep 29;185(20):3705-3719.e14.

doi: 10.1016/j.cell.2022.09.007.

【日报解读】Cell：特定抗生素让拟杆菌破坏黏液层，促移植物抗宿主病

A non-antibiotic-disrupted gut microbiome is associated with clinical responses to CD19-CAR-T cell cancer immunotherapy

Nat Med. 2023 Apr;29(4):906-916.

doi: 10.1038/s41591-023-02234-6.

【日报解读】Nature子刊：揭开肠道菌群与CAR-T免疫治疗效果间的神秘关系

Diet-derived metabolites and mucus link the gut microbiome to fever after cytotoxic cancer treatment

Sci Transl Med. 2022 Nov 16;14(671):eabo3445.

doi: 10.1126/scitranslmed.abo3445.

【日报解读】Science子刊：肠道菌群与细胞毒性癌症治疗后的发热相关！

Ruth Ley

德国马克斯·普朗克生物研究所

德国图宾根大学

Ruth Ley教授团队主要研究人类与其微生物组的共同演化，他们将人群水平的肠道菌群分析与肠菌物种水平的机制研究方法相结合，以阐释肠道微生物的演化史，它们如何适应人类，以及它们如何影响人类生物学和健康。

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2022年5月以来代表性论文（部分）

Codiversification of gut microbiota with humans

Science. 2022 Sep 16;377(6612):1328-1332.

doi: 10.1126/science.abm7759.

【日报解读】Science：肠菌与人类的共同演化

Characterization of inositol lipid metabolism in gut-associated Bacteroidetes

Nat Microbiol. 2022 Jul;7(7):986-1000.

doi: 10.1038/s41564-022-01152-6.

【日报解读】Nature子刊：肠菌如何合成肌醇脂质

Silent recognition of flagellins from human gut commensal bacteria by Toll-like receptor 5

Sci Immunol. 2023 Jan 6;8(79):eabq7001.

doi: 10.1126/sciimmunol.abq7001.

【日报解读】Science子刊：TLR5与鞭毛蛋白的“沉默”互作

Nicola Segata

意大利特伦托大学

欧洲肿瘤研究所

Nicola Segata教授团队致力于计算宏基因组学研究，通过实验宏组学工具和新的计算方法来研究微生物组的多样性及其在人类菌群失调和感染中的作用。目前其课题组主要聚焦4个方面的研究：下一代计算宏基因组学工具、综合性和机器学习的宏组学方法、人类感染中的微生物组-病原体相互作用、微生物组传播。

一

2022年5月以来代表性论文（部分）

The person-to-person transmission landscape of the gut and oral microbiomes

Nature. 2023 Feb;614(7946):125-135.

doi: 10.1038/s41586-022-05620-1.

【日报解读】Nature：1万样本+菌株水平，系统揭示人际间的菌群传播规律

Variability of strain engraftment and predictability of microbiome composition after fecal microbiota transplantation across different diseases

Nat Med. 2022 Sep;28(9):1913-1923.

doi: 10.1038/s41591-022-01964-3.

【日报解读】Nature子刊：揭示影响菌株植入的潜在因素，优化粪菌移植供受体匹配

Extending and improving metagenomic taxonomic profiling with uncharacterized species using MetaPhlAn 4

Nat Biotechnol. 2023 Feb 23.

doi: 10.1038/s41587-023-01688-w.

【日报解读】Nature子刊：MetaPhlAn再度更新，这次有何新特征？

Justin L Sonnenburg

美国斯坦福大学医学院

Justin Sonnenburg是美国斯坦福大学医学院的微生物学和免疫学副教授，也是深耕肠道菌群研究多年的知名科学家。他与团队致力于研究肠道菌群内部以及肠道菌群与宿主间的互作机制，阐明肠道菌群动态的基本机制，研发基于肠道菌群的预防和治疗人类疾病的干预策略。

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2022年5月以来代表性论文（部分）

Robust variation in infant gut microbiome assembly across a spectrum of lifestyles

Science. 2022 Jun 10;376(6598):1220-1223.

doi: 10.1126/science.abj2972.

【日报解读】Science：人类婴幼儿期的肠道菌群多样性

Impact of a 7-day homogeneous diet on interpersonal variation in human gut microbiomes and metabolomes

Cell Host Microbe. 2022 Jun 8;30(6):863-874.e4.

doi: 10.1016/j.chom.2022.05.003.

【日报解读】Cell子刊：饮食不是人类代谢组个体差异的主要原因