空间零模型的显著性检验 surface-level(顶点，脑区)，volumetric -level(体素，脑)校正——Spatial nulls for significance testing

已于 2022-10-22 21:52:12 修改
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分类专栏： 神经科学工具箱 脑科学核磁共振成像 脑网络的图论分析 文章标签： python 开发语言
于 2022-10-22 21:35:48 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/xj4math/article/details/127467323
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这篇博客介绍了如何使用neuromaps库进行空间零模型的显著性检验，涵盖了顶点级、脑区级和体积级的数据校正。内容包括安装依赖、非分区数据和分区数据的空模型应用，以及适用于MNI152空间的特定空模型。通过这些方法，可以进行相关性和p值计算，以评估大脑映射的统计显著性。
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neuromaps: structural and functional interpretation of brain maps 多模态、多尺度脑科学数据综合分析的利器
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
10-22 660
介绍了一个开放访问的Python工具箱，neuromaps，以使研究人员能够系统地共享、转换和比较脑图。neuromaps软件工具箱在[neuromaps](https://github.com/netneurolab/neuromaps)上可用
neuromaps——多模态、多尺度脑科学数据综合分析的利器 的使用
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
10-22 1558
神经图谱旨在提供一套可复制的工具，用于处理和分析大脑地图(或“注释”)。作者介绍了一个开放访问的Python工具箱，neuromaps，以使研究人员能够系统地共享、转换和比较脑图（图1）。neuromaps软件工具箱在neuromaps上可用，在PyPi、Zenodo上，它作为Docker容器存在，文档可以在GitHub页面上找到（https://netneurolab.github.io/neuromaps）。
在线作图|在线做零模型分析（null model）
weifanbio的博客
11-05 5335
零模型（Null model） 零模型（null model）是一种对装配过程进行定量比较的方法。例如，集合群落结构（EMS）方法的目的的要素来区分那些物种分拣过程组装随机组装社区，基于发生率 (Raup-Crick) 的 beta 多样性 (βRC ) 已被用于区分确定性和随机组装过程 。此外，基于系统发育相关性表明共享环境响应特征的假设，零模型方法已扩展到整合系统发育信息(Using null models to compare bacterial and microeukaryotic metacom
Neuromaps: 大脑结构和功能的图解
cc1609130201的博客
10-13 1388
在箱线图中，箱体的两端代表零模型分布的第一（25%）和第三（75%）四分位数，中心线（中位数）代表零模型分布的第二四分位数（n = 1,000旋转），线的延伸部分代表分布的非异常范围，而开放的圆圈代表异常值。其中一些图谱最初是在不再使用的坐标系统中定义的。例如，功能梯度与国家卫生研究院（NIH）的等距缩放在CIVET 41k空间中显著相关（r = 0.223，双侧Pspin = 0.049），但在fsLR 32k空间中的相关性不显著（r = 0.217，双侧Pspin = 0.097）（图5c）。
neuromaps的学习笔记
clancy_wu的博客
10-31 994
neuromaps是一款2022年8月刚发布的工具，文章发表在nature method杂志上。近期同事推荐给了我，于是我尝试用了下。首先的话，neuromaps是一款主要用于脑区之间进行比较的工具，使用的是基于空模型的非参数方法-置换检验。
High-energy all-fiber gain-switched thulium-doped fiber laser for volumetric photoacoustic imaging of lipids
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We demonstrate a high-energy all-fiber short wavelength gain-switched thulium-doped fiber laser for volumetric photoacoustic (PA) imaging of lipids. The laser cavity is constructed by embedding a ...
Iso2Mesh - a 3D surface and volumetric mesh generator for MATLAB
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在Volumetric-3D映射中，我们关注的是“体积”，即对三维空间内部的每一个点进行处理，构建出一个连续的、有密度的体数据。这种技术通常用于创建逼真的烟雾、火焰、云层等动态效果。 CPU实现的实时3D映射面临的主要...
UniStorm-Volumetric-Clouds-Sky
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四种简单的图像显著性区域特征提取方法-----> AC/HC/LC/FT。 分类： 图像处理 2014-08-03 12:40 4088人阅读 评论(4) 收藏 举报 salient region detec显著性检测 laviewpbt 2014.8.3 编辑 Email：laviewpbt@sina.com QQ：33184777 最近闲来蛋痛，看了一些显著性检测的文章...
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【零基础Eviews实例】00了解多元线性回归模型常见检验
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