生物信息神奇网站系列（十六）：Notebook Gallery

最新推荐文章于 2023-03-22 11:17:05 发布
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分类专栏： 生物信息神奇网站
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Notebook Gallery网站汇集大量Jupyter Notebook编写的Python学习资料，涵盖数据分析经典书籍，提供按时间及热度排序，支持在Jupyter.org上直接运行代码。通过Anaconda安装Jupyter Notebook，能便捷地学习和运行Python代码。
摘要由CSDN通过智能技术生成

前面我们已经介绍过过不少Gallery，包括R绘图与Python绘图，见下面链接。现在python越来越火了，而Jupyter Notebook工具可以极大方便python的学习，可以将代码与执行结果合二为一，非常方便文章的书写。Notebook Gallery网站收集大量利用Jupyter Notebook书写的文档，方便python学习。
十六：Notebook Gallery

http://nb.bianp.net/

1、打开网页，默认按照时间顺序排序，可以看到每天都有不少更新。

在这里插入图片描述

2、可以使用Most Viewed排序，这里排在前面的文档有《利用Python进行数据分析》这本经典书籍。

在这里插入图片描述

3、点开《利用Python进行数据分析》，直接连接到jupyter.org网站，可以直接在ipython中运行这些代码。

在这里插入图片描述

4、在https://nbviewer.jupyter.org/网站可以找到这本书全部的代码。

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生物信息神奇网站系列（一）：R绘图Gallery
xxxie_的博客
07-08 6016
“君子生非异也，善假于物也”。学习生物信息有非常多好的资源站点，这些资源站点包罗万象，提供了非常多好的资源，无论是生物信息入门还是提高都非常有帮助，这里我们精选一批优秀网站，作为我们的第二个专栏，以飨读。 一：r-graph-gallery http://www.r-graph-gallery.com/ 1、r-garp-gallery收入了大量利用R语言绘制的图形，这些图形包含了很多方面，通过...
生信分析平台使用指导
ocean_1996的博客
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生信发行版使用指导 1. 环境配置 鲲鹏服务器一台（或ARM64服务器一台） 安装docker（运行docker查看服务器是否已安装） 2. 启用生信发行版 初始运行命令，创建并进入docker容器。（服务器只需启动一次，无需重复启动） sudo docker run -p 9090:8888 -e JUPYTER_ENABLE_LAB=yes -v /home/:/home/jovyan/mywork -it --user root -n mybiojupyter biojupyter:v
Jupyter notebook: Notebook validation failed: 'execution_count' is a required property
DREAM BIGGER
03-08 6361
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使用jupyter lab愉快地编程
zd200572的博客
10-22 805
最近发现生信技能树VIP论坛群里在讨论jupyter lab这么一个工具，内心想尝试一下，毕竟一个好工具或许就可以改变你的学习态度和进程，工欲善其事，必先利其器嘛。我使用了这个工具之后，感觉又重新燃起了对R语言的学习热情呢。当然，手上的技能树讲义讲得好也至关重要。下面就说说我安装使用这个工具遇到的一点问题和解决的过程。 背景 先说一下我的使用背景，刚升级了16GB内存和固态硬盘，装上了最新版的...
Jupyter lab 几个好用的小功能
Skye's Blog
02-29 3989
Jupyter lab 界面简介 几个常用的小功能 tab 按住tab补全函数 XX？ 可以直接在函数后面添加“?”查看变数的文档资料 print? # Docstring: # print(value, ..., sep=' ', end='\n', file=sys.stdout, flush=False) # Prints the values to a stream, or ...
jupyter notebook系列1：调用文件内自定义的函数
ting的博客
07-20 4123
在工作目录下放置importer.py文件，就可以正常调用jupyternotebook文件。这种方法的本质就是使用一个jupyternotenook解析器先对.ipynb文件进行解析，把文件内的各个模块加载到内存里供其他python文件调用。......
手把手教你安装Jupyter Notebook(保姆级教程)
最新发布
m0_68678046的博客
03-22 24万+
Jupyter Notebook安装教程
python学习系列二：jupyter notebook中调用其他.ipynb模块内的变量或者函数
swy12的专栏
11-29 3694
大致方法有三： 1、直接将被掉文件转为.py格式 可在终端运行：jupyter nbconvert --to python XXX.ipynb #XXX.ipynb就是你想调用的.ipynb文件 2、在每个.ipynb文件后面添加自动转换命令 try: !jupyter nbconvert --to python import_test.ipynb #注意这是shell...
Databricks 第12篇：Notebook 工作流
悦光阴的博客
11-17 1645
Databricks 集成了命令行，比如 %run，允许用户在一个Notebook中去执行指定的notebook，当运行 %run时，被调用的notebook会立即执行。 %run <notebook_path_name> %run命令相当于Python语言中的import语句，在被调用notebook中定义的所有变量在当前的notebook中都可用。 注意：%run命令必须独占...
python：notebook安装与使用
碧海蓝天
04-05 1429
用处 notebook的最大好处是完美结合了：code运行+markdown文档。 安装 安装anaconda，自带notebook应用 使用方法 常用快捷键 命令模式(command mode) 编辑模式下按Esc进入命令模式 快捷键 作用 快捷键 作用 A insert cell above B insert cell below D+D delete cell Y to ...
史上最全的Python数据分析工具：Notebook教程
weixin_44386638的博客
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Python 代码编辑器怎么选？PyCharm、VS Code、Jupyter Notebook 都各有特色。 对于大型代码库，最好还是用传统的 IDE 比较靠谱，但是数据分析等需要可视化操作的场景下，Jupyter Notebook就太适合了。老胡比较喜欢的是JupyterLab，这是Jupyter主打的最新数据科学生产工具，你可以使用它编写notebook、操作终端、编辑markdown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 JupyterLab的安装配置还是有一些麻烦的，这里分享一下小经验
Ubuntu安装Mininet教程
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1 安装Mininet 安装git sudo apt-get install git 下载代码 git clone git://github.com/mininet/mininet 然后进入mininet/util目录，执行安装命令-a表示全部安装 cd mininet cd util sudo ./install.sh -a 安装完毕会输出Enjoy Mininet！ ...
数据科学笔记本变得真实了：JupyterLab已面向用户发行
首席IT民工的博客
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作者：Andrew Brust原文地址：http://www.zdnet.com/article/can-data-science-notebooks-get-real-jupyter-lab-releases-to-users/ 副标题：Jupyter 笔记本已经突破了他们“展示和讲解”的角色，正变得更适合数据工程师使用。JupyterLab 会把这些笔记本升级成一款企业级工具吗？译者：首席IT...
生物信息神奇网站系列（四）：Biostars
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biostars其实是一个问答网站，与国外很多IT技术或者数据分析的热门问答网站类似，例如stackoverflow，不过biostars是专注于生物信息类的问答，随着生物信息行业的兴起，生物数据分析的流行，biostars人气也越来越高。通过这么多年的累计，几乎你所遇到的技术问题，这里面都能找到答案。 四：Biostars https://www.biostars.org/ 1、典型的问答类网站...
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xxxie_的博客
07-22 2578
上一次推送中我们介绍了已发表动物基因组，植物同样重要。目前已经有很多熟知的粮食蔬菜水果类等植物基因组发表出来，也包括很多重要经济作物等。例如水稻，玉米，高粱，大豆，小麦，土豆，白菜，西红柿（别拿我不当蔬菜），甘蓝，苹果，西瓜，梨等等。同样还是在维基百科有详细列表，可以通过这个网址查看已发表植物基因组。 二十：已发表植物基因组 https://en.wikipedia.org/wiki/List_o...
生物信息神奇网站系列（六）：Omictools
xxxie_的博客
07-09 2519
做生物信息一定需要使用生物软件，那么就会有遇到几个问题：这个分析使用哪款软件，有哪些软件可选，哪一个更好，从哪里找软件，如何下载，如何安装，如何使用？Omictools是一个生物软件的集合网站，并按软件功能和热度对软件进行整理和排序，使用omictools，老板再也不用担心我该使用哪款软件了。 六：生物软件集合Omictools https://omictools.com/ 1、首页既是一个醒目的...
MATLAB使用详解：Notebook基础与应用
"本资源是一份关于MATLAB使用的详细教程，特别关注第21章‘Notebook的运用’。Notebook结合了Word的文字处理能力和MATLAB的数学计算能力，适用于编写报告、记录代码操作、项目管理和演示。本章涵盖了Notebook的安装...
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